More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dole_1200 on replicon NC_009943
Organism: Desulfococcus oleovorans Hxd3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  929    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  63.62 
 
 		 448 aa  617  1e-175  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  36.73 
 
 		 460 aa  287  2.9999999999999996e-76  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  28.64 
 
 		 479 aa  165  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.94 
 
 		 426 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  28.13 
 
 		 480 aa  152  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.16 
 
 		 464 aa  151  3e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.19 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.91 
 
 		 450 aa  144  4e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  26.19 
 
 		 459 aa  141  3e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  29.33 
 
 		 453 aa  140  4.999999999999999e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 448 aa  140  6e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.54 
 
 		 450 aa  137  4e-31  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.73 
 
 		 446 aa  136  8e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.86 
 
 		 469 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.48 
 
 		 457 aa  133  5e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  27.21 
 
 		 453 aa  127  5e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  28.21 
 
 		 502 aa  127  5e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  26.93 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.46 
 
 		 451 aa  126  9e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.5 
 
 		 437 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  26.42 
 
 		 445 aa  124  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  29.76 
 
 		 458 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  26.76 
 
 		 446 aa  123  6e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  23.67 
 
 		 448 aa  121  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.08 
 
 		 439 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.26 
 
 		 441 aa  116  7.999999999999999e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  26.69 
 
 		 433 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.24 
 
 		 453 aa  113  8.000000000000001e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  27.3 
 
 		 487 aa  105  2e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.46 
 
 		 434 aa  104  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.55 
 
 		 433 aa  100  7e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.2 
 
 		 436 aa  99.8  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  27.08 
 
 		 427 aa  99.4  1e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.2 
 
 		 461 aa  99  1e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  27.03 
 
 		 430 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  26.87 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  26.59 
 
 		 414 aa  97.8  4e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.39 
 
 		 438 aa  97.8  4e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.71 
 
 		 454 aa  97.4  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  26.73 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  26.59 
 
 		 436 aa  96.3  9e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  22.6 
 
 		 463 aa  95.9  1e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  26.39 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  24.63 
 
 		 433 aa  95.9  1e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  26.43 
 
 		 431 aa  95.5  1e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  24.58 
 
 		 472 aa  95.1  2e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0760  phenylacetate-CoA ligase  26.38 
 
 		 438 aa  95.1  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  26.13 
 
 		 433 aa  94.4  4e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2408  Phenylacetate--CoA ligase  26.32 
 
 		 429 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.0464701 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  25.18 
 
 		 433 aa  93.6  7e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.43 
 
 		 475 aa  93.6  7e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 		 432 aa  92.8  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.48 
 
 		 433 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.72 
 
 		 563 aa  92.8  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  27 
 
 		 481 aa  92.8  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.96 
 
 		 468 aa  92.8  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  25.74 
 
 		 435 aa  92.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  25.8 
 
 		 414 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  25.6 
 
 		 428 aa  92  2e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.54 
 
 		 429 aa  92.4  2e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.05 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  25.71 
 
 		 447 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  24.28 
 
 		 429 aa  90.9  4e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  25.29 
 
 		 434 aa  90.9  5e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  26.79 
 
 		 436 aa  90.9  5e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.33 
 
 		 435 aa  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 432 aa  89.7  1e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  26.27 
 
 		 433 aa  88.2  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 425 aa  89  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  24.57 
 
 		 413 aa  88.2  3e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.29 
 
 		 429 aa  87.8  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.61 
 
 		 461 aa  87.8  3e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  25.49 
 
 		 444 aa  87.8  4e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  24.5 
 
 		 433 aa  87.4  5e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  27.14 
 
 		 434 aa  86.7  7e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.88 
 
 		 432 aa  86.7  9e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  25.52 
 
 		 428 aa  85.9  0.000000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.68 
 
 		 432 aa  85.5  0.000000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  27.14 
 
 		 433 aa  85.1  0.000000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  26.52 
 
 		 445 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  29.5 
 
 		 416 aa  85.1  0.000000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  25.66 
 
 		 440 aa  85.5  0.000000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  24.7 
 
 		 433 aa  84.7  0.000000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  24.18 
 
 		 437 aa  84.7  0.000000000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  32.39 
 
 		 480 aa  84.7  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  25.91 
 
 		 445 aa  84.3  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  26.69 
 
 		 412 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 434 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.3 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  25.35 
 
 		 442 aa  84  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  23.58 
 
 		 444 aa  84  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.53 
 
 		 425 aa  84  0.000000000000006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  26.15 
 
 		 447 aa  83.6  0.000000000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  24.93 
 
 		 433 aa  83.2  0.000000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.21 
 
 		 415 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  25.08 
 
 		 433 aa  82.4  0.00000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  25.3 
 
 		 433 aa  82.8  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>