More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3882 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  100 
 
 		 480 aa  1001    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  37.75 
 
 		 446 aa  336  5e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  33.19 
 
 		 448 aa  234  3e-60  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  33.26 
 
 		 469 aa  230  4e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.65 
 
 		 457 aa  226  8e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.91 
 
 		 451 aa  218  2e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.64 
 
 		 453 aa  214  2.9999999999999995e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  30.8 
 
 		 453 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  30.37 
 
 		 448 aa  208  2e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  28.92 
 
 		 459 aa  196  1e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  30.92 
 
 		 439 aa  193  7e-48  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  31.26 
 
 		 445 aa  186  9e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  30.05 
 
 		 502 aa  184  3e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  29.39 
 
 		 446 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  28.54 
 
 		 450 aa  180  4e-44  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  30.02 
 
 		 464 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  28.98 
 
 		 458 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.39 
 
 		 454 aa  172  1e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.4 
 
 		 453 aa  171  3e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.12 
 
 		 475 aa  170  6e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  29.34 
 
 		 461 aa  169  8e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.86 
 
 		 450 aa  168  2e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.17 
 
 		 426 aa  161  3e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.95 
 
 		 461 aa  160  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  29.09 
 
 		 448 aa  154  5e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  27.74 
 
 		 437 aa  152  2e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  29.22 
 
 		 416 aa  149  1.0000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  25.71 
 
 		 475 aa  144  5e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  28.13 
 
 		 448 aa  143  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.33 
 
 		 437 aa  143  8e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.62 
 
 		 468 aa  138  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  26.81 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.61 
 
 		 436 aa  134  3.9999999999999996e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  26.34 
 
 		 460 aa  129  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.27 
 
 		 467 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  23.02 
 
 		 463 aa  128  2.0000000000000002e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.3 
 
 		 446 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  26.58 
 
 		 479 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25 
 
 		 466 aa  119  1.9999999999999998e-25  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.94 
 
 		 563 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  35.12 
 
 		 460 aa  116  7.999999999999999e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  25.9 
 
 		 435 aa  116  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  23.87 
 
 		 432 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  26.57 
 
 		 417 aa  110  5e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.71 
 
 		 432 aa  108  1e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.88 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  24.07 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  25.6 
 
 		 428 aa  107  6e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  26.13 
 
 		 430 aa  104  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  27.22 
 
 		 443 aa  105  3e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.72 
 
 		 434 aa  103  5e-21  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  26.83 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  26.4 
 
 		 414 aa  102  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  26.37 
 
 		 447 aa  101  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.45 
 
 		 429 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  27.22 
 
 		 450 aa  100  8e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.17 
 
 		 425 aa  99.8  1e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  30.91 
 
 		 466 aa  99.4  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  24.79 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  26.99 
 
 		 445 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  24.68 
 
 		 433 aa  99  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  23.95 
 
 		 476 aa  99  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  20.74 
 
 		 472 aa  98.6  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  26.75 
 
 		 414 aa  99  2e-19  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.51 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.2 
 
 		 432 aa  98.6  2e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  24.65 
 
 		 415 aa  97.8  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  22.7 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  25.93 
 
 		 481 aa  97.4  5e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.15 
 
 		 432 aa  97.1  6e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  28.11 
 
 		 524 aa  97.1  7e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  22.82 
 
 		 433 aa  96.7  9e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 447 aa  96.7  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  24.84 
 
 		 436 aa  95.9  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  26.1 
 
 		 455 aa  95.9  2e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.99 
 
 		 468 aa  95.5  2e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.59 
 
 		 480 aa  95.9  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  22.82 
 
 		 433 aa  95.1  3e-18  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  22.88 
 
 		 427 aa  94.7  3e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  25.34 
 
 		 435 aa  94.4  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 445 aa  94.4  4e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.53 
 
 		 433 aa  94.7  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  24.67 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 416 aa  94  5e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  24.67 
 
 		 433 aa  94  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  24.86 
 
 		 412 aa  93.6  6e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  24.34 
 
 		 418 aa  93.6  7e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  24.26 
 
 		 435 aa  93.2  9e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  25.59 
 
 		 436 aa  92.4  1e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  25.98 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.67 
 
 		 487 aa  92.8  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  26.14 
 
 		 433 aa  92.4  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  25.06 
 
 		 435 aa  92.4  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  24.25 
 
 		 432 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 444 aa  92.4  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  23.1 
 
 		 433 aa  91.7  2e-17  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  25.25 
 
 		 456 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 415 aa  90.9  4e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  24.52 
 
 		 432 aa  91.3  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>