More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_3212 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 460 aa  925    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  51.98 
 
 		 466 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  47.53 
 
 		 480 aa  355  1e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  40.45 
 
 		 461 aa  266  4e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  39.39 
 
 		 456 aa  262  1e-68  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.66 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.66 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.66 
 
 		 454 aa  222  9e-57  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  32.36 
 
 		 563 aa  207  4e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  43.07 
 
 		 268 aa  179  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  30.17 
 
 		 472 aa  169  8e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.49 
 
 		 468 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  35.12 
 
 		 480 aa  122  9.999999999999999e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1959  coenzyme F390 synthetase-like  36.24 
 
 		 239 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.872302  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  31.92 
 
 		 469 aa  107  4e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.51 
 
 		 454 aa  107  5e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  27.27 
 
 		 433 aa  107  6e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  26.44 
 
 		 428 aa  106  8e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  26.44 
 
 		 428 aa  106  9e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  26.44 
 
 		 428 aa  105  2e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  32.47 
 
 		 448 aa  105  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  36.04 
 
 		 462 aa  104  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  28.26 
 
 		 459 aa  104  4e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  24.87 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  101  3e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  32.86 
 
 		 475 aa  100  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  24.49 
 
 		 445 aa  100  6e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  30.7 
 
 		 450 aa  100  6e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  31.93 
 
 		 458 aa  99.8  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.44 
 
 		 446 aa  99.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.25 
 
 		 450 aa  99  1e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  22.97 
 
 		 493 aa  99  2e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  22.97 
 
 		 493 aa  98.2  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.61 
 
 		 451 aa  98.2  3e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.52 
 
 		 457 aa  97.4  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.47 
 
 		 453 aa  96.7  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  24.43 
 
 		 445 aa  96.7  8e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  27.81 
 
 		 464 aa  96.3  9e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  26.8 
 
 		 441 aa  95.5  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  24.36 
 
 		 442 aa  95.1  2e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.1 
 
 		 475 aa  95.5  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  27.96 
 
 		 428 aa  95.5  2e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  28.1 
 
 		 453 aa  94.7  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  27.57 
 
 		 428 aa  95.1  3e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  25.06 
 
 		 427 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  28.77 
 
 		 445 aa  91.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  31.38 
 
 		 453 aa  90.9  4e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  33.12 
 
 		 461 aa  87.8  4e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  27.87 
 
 		 426 aa  87.4  5e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  26.83 
 
 		 435 aa  86.7  8e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.44 
 
 		 436 aa  86.3  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  33.69 
 
 		 448 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  30.1 
 
 		 502 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  26.19 
 
 		 463 aa  84.7  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.14 
 
 		 466 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  28.82 
 
 		 426 aa  84  0.000000000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.63 
 
 		 437 aa  84  0.000000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.71 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  26.71 
 
 		 436 aa  82.4  0.00000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  32.45 
 
 		 446 aa  82  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  26.38 
 
 		 437 aa  80.5  0.00000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  32.76 
 
 		 448 aa  80.1  0.00000000000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  37.6 
 
 		 479 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.74 
 
 		 476 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  27.16 
 
 		 425 aa  79.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  32.14 
 
 		 447 aa  79.7  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  31.63 
 
 		 445 aa  79.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  33.67 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  32.12 
 
 		 432 aa  78.6  0.0000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  35.26 
 
 		 413 aa  79  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  25.26 
 
 		 446 aa  77.8  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  23.73 
 
 		 430 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  31.05 
 
 		 445 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.91 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  26.09 
 
 		 439 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  26.3 
 
 		 424 aa  76.6  0.0000000000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  32 
 
 		 433 aa  77  0.0000000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  29.86 
 
 		 433 aa  76.6  0.0000000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  29.59 
 
 		 435 aa  76.3  0.000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.91 
 
 		 433 aa  76.3  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  35.08 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  29.95 
 
 		 416 aa  75.1  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  32.73 
 
 		 428 aa  75.5  0.000000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2115  coenzyme F390 synthetase  30.89 
 
 		 447 aa  74.7  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 458 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  33.95 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.25 
 
 		 452 aa  74.3  0.000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28.91 
 
 		 433 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  31.86 
 
 		 428 aa  73.9  0.000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32.08 
 
 		 432 aa  73.9  0.000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  34.81 
 
 		 412 aa  73.9  0.000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4395  hypothetical protein  33.79 
 
 		 198 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  29.78 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  32.97 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  32.67 
 
 		 427 aa  73.2  0.000000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  25.52 
 
 		 361 aa  72.8  0.00000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  35.12 
 
 		 438 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  23.12 
 
 		 435 aa  73.2  0.00000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>