170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2214 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  100 
 
 		 428 aa  884    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  99.3 
 
 		 428 aa  880    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  99.07 
 
 		 428 aa  876    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  70.26 
 
 		 427 aa  610  1e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  67.85 
 
 		 428 aa  591  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  67.61 
 
 		 428 aa  586  1e-166  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  36.22 
 
 		 445 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  36.22 
 
 		 445 aa  299  5e-80  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  36.22 
 
 		 445 aa  299  7e-80  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  35.99 
 
 		 445 aa  298  1e-79  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  36.05 
 
 		 445 aa  297  2e-79  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  35.93 
 
 		 445 aa  296  7e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  40.69 
 
 		 426 aa  286  2.9999999999999996e-76  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  42.42 
 
 		 424 aa  271  2e-71  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  36.22 
 
 		 430 aa  265  2e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  38.38 
 
 		 419 aa  246  4e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  37.38 
 
 		 433 aa  233  4.0000000000000004e-60  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.27 
 
 		 460 aa  103  8e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  26.94 
 
 		 456 aa  100  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.05 
 
 		 468 aa  96.3  1e-18  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.24 
 
 		 480 aa  94.7  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  23.45 
 
 		 472 aa  90.5  6e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  25.14 
 
 		 466 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.54 
 
 		 563 aa  80.1  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.66 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  33.96 
 
 		 268 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  27.11 
 
 		 450 aa  73.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.4 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.07 
 
 		 466 aa  72.8  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  24.24 
 
 		 467 aa  72  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.46 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.46 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.46 
 
 		 454 aa  70.5  0.00000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  33.33 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  27.38 
 
 		 524 aa  69.7  0.00000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  29.6 
 
 		 361 aa  69.3  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  21.97 
 
 		 493 aa  67.4  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  22.45 
 
 		 493 aa  67  0.0000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  20.54 
 
 		 437 aa  66.6  0.0000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.13 
 
 		 452 aa  65.1  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  24.14 
 
 		 425 aa  63.5  0.000000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  25.98 
 
 		 450 aa  61.6  0.00000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  27.94 
 
 		 448 aa  62  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  30.25 
 
 		 417 aa  62  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  26.36 
 
 		 426 aa  60.8  0.00000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  29.21 
 
 		 437 aa  60.5  0.00000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  29.65 
 
 		 462 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  30.23 
 
 		 459 aa  60.5  0.00000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.59 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.01 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  29.71 
 
 		 441 aa  60.1  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  31.08 
 
 		 453 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.6 
 
 		 458 aa  59.3  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.3 
 
 		 446 aa  58.2  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  22.49 
 
 		 463 aa  58.2  0.0000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1469  hypothetical protein  25.14 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  24.55 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.24 
 
 		 461 aa  58.2  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  25 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  32.19 
 
 		 449 aa  57.4  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  30.04 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  21.43 
 
 		 442 aa  57.4  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  22.19 
 
 		 461 aa  56.6  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.67 
 
 		 457 aa  56.6  0.0000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.75 
 
 		 439 aa  56.2  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.11 
 
 		 451 aa  55.5  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  22.13 
 
 		 443 aa  54.7  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  22.35 
 
 		 433 aa  55.1  0.000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  28.81 
 
 		 435 aa  54.7  0.000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.52 
 
 		 475 aa  53.5  0.000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.81 
 
 		 453 aa  53.1  0.000009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  42 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4074  phenylacetate-CoA ligase  24.42 
 
 		 437 aa  53.1  0.000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.073347 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  31.46 
 
 		 441 aa  53.1  0.000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  22.28 
 
 		 435 aa  52.4  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  23.18 
 
 		 447 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  44 
 
 		 433 aa  52.8  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  22.62 
 
 		 448 aa  52.8  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.67 
 
 		 467 aa  52  0.00002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  25.73 
 
 		 453 aa  51.6  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.17 
 
 		 428 aa  51.6  0.00003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2458  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  22.98 
 
 		 451 aa  51.6  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  27.67 
 
 		 469 aa  50.8  0.00004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  30.57 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  23.02 
 
 		 438 aa  50.8  0.00004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  22.13 
 
 		 442 aa  50.8  0.00005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  21.88 
 
 		 432 aa  50.1  0.00008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.1 
 
 		 460 aa  49.7  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  28.41 
 
 		 458 aa  49.7  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  23.23 
 
 		 433 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 		 429 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  22.1 
 
 		 433 aa  49.7  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  33.06 
 
 		 464 aa  49.3  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  32.41 
 
 		 436 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.24 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  21.62 
 
 		 427 aa  48.9  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  23.68 
 
 		 434 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1405  ABC transporter related  24.14 
 
 		 694 aa  48.5  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112025  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  36 
 
 		 432 aa  48.5  0.0002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  27.03 
 
 		 481 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>