51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_002732 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 419 aa  877    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3110  adenylate-forming enzyme  39.78 
 
 		 430 aa  293  4e-78  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00628752  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  39.01 
 
 		 445 aa  269  5.9999999999999995e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  37.96 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  38.48 
 
 		 445 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  37.7 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  37.7 
 
 		 445 aa  266  5.999999999999999e-70  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  37.7 
 
 		 445 aa  263  4e-69  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  38.48 
 
 		 428 aa  248  1e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2214  adenylate-forming enzyme  38.38 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.362513  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2104  hypothetical protein  38.38 
 
 		 428 aa  246  4e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2503  hypothetical protein  38.38 
 
 		 428 aa  246  6e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000239215 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2866  putative adenylate-forming enzyme  37.3 
 
 		 427 aa  246  6.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.879124 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  38.17 
 
 		 428 aa  244  9.999999999999999e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1598  hypothetical protein  38.31 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0672  putative adenylate-forming enzyme  35.26 
 
 		 426 aa  223  7e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.393226  normal  0.19612 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0374  putative adenylate-forming enzyme  35.29 
 
 		 433 aa  190  2.9999999999999997e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0076  coenzyme F390 synthetase  25.23 
 
 		 442 aa  97.4  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.743579  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  25 
 
 		 456 aa  83.2  0.000000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  24.11 
 
 		 472 aa  82.8  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.85 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
NC_008539  Arth_4211  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.85 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.494942  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4480  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.85 
 
 		 454 aa  79.3  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.29 
 
 		 563 aa  73.2  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.13 
 
 		 480 aa  70.9  0.00000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.87 
 
 		 461 aa  65.5  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.91 
 
 		 468 aa  65.5  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.55 
 
 		 460 aa  62  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  22.98 
 
 		 466 aa  60.1  0.00000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  29.49 
 
 		 469 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1296  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.65 
 
 		 413 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  22.92 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  22.64 
 
 		 493 aa  55.1  0.000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1919  hypothetical protein  22.64 
 
 		 493 aa  55.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  22.86 
 
 		 476 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  24.69 
 
 		 446 aa  51.6  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  24.75 
 
 		 462 aa  51.6  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  21.27 
 
 		 446 aa  51.2  0.00003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.3 
 
 		 436 aa  50.8  0.00004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.54 
 
 		 268 aa  50.8  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  21.95 
 
 		 480 aa  49.7  0.00009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.07 
 
 		 466 aa  48.5  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  23.99 
 
 		 440 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  21.67 
 
 		 458 aa  47.4  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  26.71 
 
 		 361 aa  47.4  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  20.42 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2226  coenzyme F390 synthetase/phenylacetyl-CoA ligase  21.15 
 
 		 450 aa  44.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.457159 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  21.43 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  23.73 
 
 		 412 aa  43.5  0.006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  23.78 
 
 		 426 aa  43.5  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.84 
 
 		 463 aa  43.1  0.01  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>