43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1296 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_1296  Coenzyme F390 synthetase-like protein  100 
 
 		 413 aa  856    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.295387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0672  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.8 
 
 		 426 aa  129  1.0000000000000001e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  23.35 
 
 		 469 aa  58.5  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.47 
 
 		 454 aa  58.9  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  22.76 
 
 		 476 aa  57  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002732  coenzyme F390 synthetase  23.65 
 
 		 419 aa  55.8  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.51 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.42 
 
 		 455 aa  52.8  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  20.97 
 
 		 463 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.73 
 
 		 475 aa  52  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.55 
 
 		 426 aa  51.2  0.00003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  21.99 
 
 		 460 aa  50.4  0.00006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  24.91 
 
 		 457 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  31.45 
 
 		 448 aa  48.1  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.6 
 
 		 452 aa  48.1  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  26.61 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  24.72 
 
 		 449 aa  48.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.29 
 
 		 466 aa  48.1  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.71 
 
 		 468 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  24.31 
 
 		 435 aa  48.1  0.0003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1817  coenzyme F390 synthetase  31.87 
 
 		 465 aa  47.4  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.342453  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  22.07 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24.3 
 
 		 448 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  23.86 
 
 		 450 aa  46.6  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  20.87 
 
 		 487 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.78 
 
 		 448 aa  46.6  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  28.26 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  22.58 
 
 		 479 aa  45.8  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  25.23 
 
 		 481 aa  45.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.28 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 434 aa  45.4  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 444 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  23.85 
 
 		 458 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  34.78 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480543  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  22.6 
 
 		 439 aa  44.3  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  22.83 
 
 		 437 aa  44.3  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  24.32 
 
 		 433 aa  43.5  0.006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32330  coenzyme F390 synthetase  31.25 
 
 		 548 aa  43.5  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.530062 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1908  hypothetical protein  23.16 
 
 		 493 aa  43.5  0.007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  29.61 
 
 		 439 aa  43.5  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  24.24 
 
 		 436 aa  43.1  0.009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3044  hypothetical protein  32 
 
 		 573 aa  43.1  0.009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.584506  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  25.65 
 
 		 411 aa  43.1  0.009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>