More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_32330 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_32330  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 548 aa  1051    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.530062 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1448  AMP-dependent synthetase and ligase  53.08 
 
 		 499 aa  346  5e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.480543  normal  0.642878 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 426 aa  77.8  0.0000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  26.21 
 
 		 432 aa  76.6  0.000000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  25.65 
 
 		 433 aa  75.5  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  33.52 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  28.06 
 
 		 427 aa  75.5  0.000000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  40.83 
 
 		 461 aa  75.1  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.08 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  24.93 
 
 		 426 aa  73.6  0.000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  29.3 
 
 		 437 aa  73.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  29.43 
 
 		 457 aa  73.2  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  26.36 
 
 		 432 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  25.43 
 
 		 434 aa  72  0.00000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  33.73 
 
 		 445 aa  71.6  0.00000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  26.74 
 
 		 433 aa  70.9  0.00000000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  27.27 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  29.9 
 
 		 434 aa  70.5  0.00000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  25.87 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  26.74 
 
 		 433 aa  70.5  0.00000000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  34.87 
 
 		 502 aa  70.5  0.00000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  31.46 
 
 		 479 aa  70.5  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  30.21 
 
 		 434 aa  69.7  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  26.45 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  29.86 
 
 		 434 aa  70.1  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.23 
 
 		 438 aa  68.9  0.0000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.86 
 
 		 469 aa  69.3  0.0000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  28.1 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  25.89 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 445 aa  68.6  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  28.75 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  23.84 
 
 		 439 aa  68.2  0.0000000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  27.39 
 
 		 434 aa  68.2  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  26.63 
 
 		 443 aa  67.4  0.0000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1878  coenzyme F390 synthetase  29.55 
 
 		 379 aa  66.6  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  30.21 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  25.58 
 
 		 434 aa  65.9  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  26.89 
 
 		 433 aa  65.9  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  27.87 
 
 		 458 aa  65.9  0.000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  28.67 
 
 		 434 aa  66.2  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1284  AMP-dependent synthetase and ligase  31.31 
 
 		 383 aa  65.1  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  25.51 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  25.51 
 
 		 433 aa  65.5  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  27.91 
 
 		 441 aa  65.1  0.000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  23.75 
 
 		 439 aa  64.7  0.000000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  30.12 
 
 		 450 aa  63.9  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.07 
 
 		 464 aa  64.3  0.000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 		 446 aa  63.9  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  28.27 
 
 		 435 aa  63.9  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  28.16 
 
 		 444 aa  63.9  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  25.08 
 
 		 433 aa  63.5  0.000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  26.39 
 
 		 432 aa  63.5  0.000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.05 
 
 		 435 aa  62.8  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  23.97 
 
 		 435 aa  63.2  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  27.99 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 439 aa  63.2  0.00000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  29.51 
 
 		 450 aa  62.8  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 439 aa  62.4  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 432 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  27.13 
 
 		 434 aa  62.8  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  27.33 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  33.92 
 
 		 448 aa  62.8  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  27.65 
 
 		 439 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.56 
 
 		 433 aa  62.4  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  34.29 
 
 		 434 aa  62  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  24.2 
 
 		 436 aa  62  0.00000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  27.59 
 
 		 439 aa  62  0.00000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1592  putative phenylacetate-coenzyme A ligase  37.1 
 
 		 397 aa  61.6  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  27.49 
 
 		 434 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  27.82 
 
 		 434 aa  61.6  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.6  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 449 aa  61.6  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.44 
 
 		 377 aa  60.8  0.00000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0919  putative coenzyme F390 synthetase II  32.26 
 
 		 470 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000099309  normal  0.0220343 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  26.67 
 
 		 432 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.68 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  24.61 
 
 		 435 aa  60.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  28.28 
 
 		 448 aa  60.8  0.00000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  27.3 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  28.05 
 
 		 431 aa  60.8  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  30.48 
 
 		 430 aa  60.5  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  27.67 
 
 		 428 aa  60.5  0.00000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  23.3 
 
 		 439 aa  60.5  0.00000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  28.03 
 
 		 432 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  32.72 
 
 		 446 aa  60.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  31.67 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 433 aa  60.5  0.00000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.9 
 
 		 444 aa  60.5  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  23.15 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  25.62 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  29.33 
 
 		 451 aa  59.7  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 429 aa  59.7  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.76 
 
 		 438 aa  60.1  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.47 
 
 		 461 aa  59.7  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>