More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0919 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0919  putative coenzyme F390 synthetase II  100 
 
 		 470 aa  973    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000099309  normal  0.0220343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1512  coenzyme F390 synthetase-like  37.47 
 
 		 452 aa  320  3e-86  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  32.83 
 
 		 428 aa  191  2e-47  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  32.72 
 
 		 432 aa  191  2e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  34.39 
 
 		 447 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.18 
 
 		 438 aa  183  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  34.1 
 
 		 445 aa  181  2e-44  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  34.75 
 
 		 430 aa  180  4.999999999999999e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  33.42 
 
 		 435 aa  180  5.999999999999999e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  30.52 
 
 		 432 aa  179  7e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  30.34 
 
 		 433 aa  178  2e-43  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  33.82 
 
 		 445 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  29.96 
 
 		 433 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  33.25 
 
 		 458 aa  177  4e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  33.41 
 
 		 432 aa  176  6e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  31.82 
 
 		 430 aa  176  9e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  31.14 
 
 		 433 aa  176  9e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  31.82 
 
 		 433 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  30.49 
 
 		 436 aa  174  3.9999999999999995e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  29.6 
 
 		 433 aa  174  3.9999999999999995e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  32.23 
 
 		 439 aa  172  1e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.41 
 
 		 429 aa  172  1e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  31.38 
 
 		 439 aa  172  2e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  31.59 
 
 		 434 aa  172  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.95 
 
 		 432 aa  172  2e-41  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  30.02 
 
 		 430 aa  170  5e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.83 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  30.61 
 
 		 434 aa  170  6e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  30.09 
 
 		 433 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  29.89 
 
 		 428 aa  168  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  31.75 
 
 		 439 aa  168  2e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30.02 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  30.84 
 
 		 434 aa  167  2.9999999999999998e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  28.76 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 433 aa  167  2.9999999999999998e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  30.41 
 
 		 435 aa  167  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  30.09 
 
 		 429 aa  167  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  31.08 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  30.07 
 
 		 434 aa  167  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  30.37 
 
 		 441 aa  166  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  30.24 
 
 		 431 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  32.34 
 
 		 435 aa  166  9e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.62 
 
 		 434 aa  166  9e-40  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 433 aa  166  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  30.3 
 
 		 433 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  30.25 
 
 		 434 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  29.2 
 
 		 436 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.05 
 
 		 433 aa  165  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  32.29 
 
 		 436 aa  165  2.0000000000000002e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  30.88 
 
 		 415 aa  164  3e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  30.77 
 
 		 433 aa  164  3e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  32.35 
 
 		 434 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  33.24 
 
 		 435 aa  164  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  32.76 
 
 		 441 aa  164  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  29.31 
 
 		 423 aa  163  6e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  28.67 
 
 		 432 aa  163  7e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  29.18 
 
 		 432 aa  162  9e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  29.38 
 
 		 423 aa  162  1e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  28.64 
 
 		 428 aa  162  1e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 445 aa  162  1e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  33.82 
 
 		 443 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  29.16 
 
 		 446 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  29.81 
 
 		 441 aa  160  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  29 
 
 		 433 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  29.83 
 
 		 433 aa  159  8e-38  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  27.43 
 
 		 413 aa  159  8e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  30.22 
 
 		 448 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  31.76 
 
 		 445 aa  159  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  31.67 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  30.8 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  29.34 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  27.42 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 432 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  29.63 
 
 		 434 aa  156  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  33 
 
 		 444 aa  156  7e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.77 
 
 		 433 aa  156  9e-37  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.99 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  29.36 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  28.41 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  28.22 
 
 		 432 aa  154  2.9999999999999998e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.16 
 
 		 433 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1845  phenylacetate-CoA ligase  32.41 
 
 		 440 aa  154  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  28.04 
 
 		 413 aa  154  4e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  28.08 
 
 		 432 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  30.79 
 
 		 433 aa  153  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 443 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  28.6 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  29.15 
 
 		 439 aa  152  1e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 434 aa  152  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  28.51 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  31.31 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  30.6 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.56 
 
 		 432 aa  152  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  29.21 
 
 		 435 aa  150  3e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>