More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1512 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1512  coenzyme F390 synthetase-like  100 
 
 		 452 aa  929    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0919  putative coenzyme F390 synthetase II  37.47 
 
 		 470 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000099309  normal  0.0220343 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  31.45 
 
 		 428 aa  177  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.63 
 
 		 432 aa  177  3e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  31.9 
 
 		 433 aa  176  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  29.8 
 
 		 432 aa  168  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  32.23 
 
 		 435 aa  166  5e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  31.06 
 
 		 432 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  30.45 
 
 		 438 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.77 
 
 		 433 aa  163  6e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  30.23 
 
 		 441 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  32.51 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  30.31 
 
 		 427 aa  160  4e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  30.18 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  29.02 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  28.45 
 
 		 437 aa  160  5e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  30.46 
 
 		 444 aa  160  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  30.4 
 
 		 444 aa  159  7e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 441 aa  159  9e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  31.64 
 
 		 432 aa  159  1e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 441 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  29.69 
 
 		 435 aa  157  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2872  phenylacetate-CoA ligase  28.95 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0742777  normal  0.0504153 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  30.48 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.56 
 
 		 431 aa  157  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.75 
 
 		 432 aa  157  4e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  30.48 
 
 		 434 aa  157  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 430 aa  157  5.0000000000000005e-37  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  28.64 
 
 		 426 aa  157  5.0000000000000005e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  29.85 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  29.5 
 
 		 423 aa  156  6e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3457  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  30.16 
 
 		 446 aa  156  8e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  28.17 
 
 		 441 aa  156  9e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  29.86 
 
 		 439 aa  155  1e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.82 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2452  phenylacetate--CoA ligase  29.19 
 
 		 432 aa  155  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.601258 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  28.95 
 
 		 428 aa  155  2e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  31.39 
 
 		 436 aa  155  2e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  27.75 
 
 		 436 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  28.16 
 
 		 435 aa  154  4e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  30.3 
 
 		 441 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.75 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  29.54 
 
 		 433 aa  152  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30.96 
 
 		 433 aa  153  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  29.24 
 
 		 429 aa  152  8.999999999999999e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  28.75 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  28.09 
 
 		 444 aa  152  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  29.9 
 
 		 430 aa  151  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  31.27 
 
 		 432 aa  151  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  28.38 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  30.05 
 
 		 435 aa  152  2e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  29.33 
 
 		 434 aa  152  2e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  29.81 
 
 		 434 aa  150  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0013  phenylacetate--CoA ligase  31.11 
 
 		 427 aa  150  3e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  29.95 
 
 		 432 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  28.64 
 
 		 433 aa  151  3e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  29.54 
 
 		 444 aa  150  4e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  29.82 
 
 		 433 aa  150  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.7 
 
 		 432 aa  150  5e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 432 aa  150  6e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 440 aa  150  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  28.51 
 
 		 443 aa  150  6e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 440 aa  150  7e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  28.21 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  28.89 
 
 		 445 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  29.38 
 
 		 423 aa  149  9e-35  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  29.22 
 
 		 433 aa  149  9e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  29.76 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  29.45 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.21 
 
 		 415 aa  149  1.0000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  27.05 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  28.64 
 
 		 444 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  26.55 
 
 		 440 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  27.19 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  27.69 
 
 		 440 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  30.48 
 
 		 441 aa  148  2.0000000000000003e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  28.18 
 
 		 434 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  28.82 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  29.53 
 
 		 436 aa  147  3e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  30.39 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  27.94 
 
 		 432 aa  147  4.0000000000000006e-34  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  29.75 
 
 		 433 aa  147  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  30.43 
 
 		 432 aa  146  6e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  28.26 
 
 		 436 aa  146  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  28.95 
 
 		 434 aa  146  9e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2051  phenylacetate-coenzyme A ligase, putative  31.03 
 
 		 433 aa  145  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.433372  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  28.94 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.65 
 
 		 434 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  26.59 
 
 		 448 aa  145  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  27.71 
 
 		 435 aa  145  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  30.11 
 
 		 432 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  28.03 
 
 		 444 aa  145  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  27.64 
 
 		 436 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  27.94 
 
 		 432 aa  144  4e-33  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.8 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  28.48 
 
 		 449 aa  143  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  29.44 
 
 		 443 aa  143  6e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>