More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0956 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0956  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 434 aa  858    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  47.58 
 
 		 432 aa  364  2e-99  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  47.34 
 
 		 432 aa  360  4e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  47.34 
 
 		 432 aa  359  6e-98  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  47.2 
 
 		 434 aa  354  1e-96  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  44.44 
 
 		 432 aa  347  3e-94  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  46.97 
 
 		 433 aa  347  3e-94  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 433 aa  345  1e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  45.93 
 
 		 439 aa  345  1e-93  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  44.79 
 
 		 433 aa  343  4e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  47.31 
 
 		 438 aa  340  2e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  44.28 
 
 		 435 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  45.67 
 
 		 433 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  43.93 
 
 		 434 aa  340  4e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  48.85 
 
 		 432 aa  339  7e-92  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  45.52 
 
 		 433 aa  338  9.999999999999999e-92  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  45.83 
 
 		 444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  45.69 
 
 		 440 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  45.5 
 
 		 433 aa  337  1.9999999999999998e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  45.69 
 
 		 440 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  44.04 
 
 		 435 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  44.07 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  45.45 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  44.55 
 
 		 434 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  46.72 
 
 		 437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  46.72 
 
 		 437 aa  337  3.9999999999999995e-91  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  47.07 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  47.07 
 
 		 440 aa  336  3.9999999999999995e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  46.82 
 
 		 440 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  45.3 
 
 		 436 aa  335  7e-91  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  48.85 
 
 		 437 aa  335  7.999999999999999e-91  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  44.07 
 
 		 434 aa  335  1e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  45.65 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  44.87 
 
 		 435 aa  335  1e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  46.51 
 
 		 432 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  48.59 
 
 		 437 aa  334  2e-90  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  46.55 
 
 		 440 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  48.21 
 
 		 436 aa  333  3e-90  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  44.04 
 
 		 433 aa  333  3e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  45.26 
 
 		 434 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  41.75 
 
 		 431 aa  333  5e-90  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  43.55 
 
 		 433 aa  332  6e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  45.26 
 
 		 433 aa  332  7.000000000000001e-90  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  46.8 
 
 		 441 aa  332  8e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  44.68 
 
 		 444 aa  332  1e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  45.08 
 
 		 446 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  45.83 
 
 		 444 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  43.55 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  44.39 
 
 		 433 aa  332  1e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  47.71 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  46.53 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  45.63 
 
 		 444 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  44.28 
 
 		 433 aa  328  8e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  44.24 
 
 		 449 aa  328  8e-89  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  44.77 
 
 		 435 aa  328  1.0000000000000001e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  43.8 
 
 		 441 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  46.79 
 
 		 433 aa  327  3e-88  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  42.82 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  45.45 
 
 		 439 aa  325  9e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  42.2 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  44.3 
 
 		 439 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2409  phenylacetate-CoA ligase  45.32 
 
 		 426 aa  324  2e-87  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1321  Phenylacetate--CoA ligase  42.96 
 
 		 449 aa  323  5e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.710343  normal  0.230718 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  48.3 
 
 		 434 aa  322  6e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  44.88 
 
 		 434 aa  322  7e-87  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  46.27 
 
 		 436 aa  322  7e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  46.65 
 
 		 443 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  43.77 
 
 		 434 aa  320  3e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  43.07 
 
 		 432 aa  320  3e-86  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  43.52 
 
 		 432 aa  320  3.9999999999999996e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  46.04 
 
 		 441 aa  319  5e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  46.9 
 
 		 443 aa  319  6e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  42.79 
 
 		 436 aa  319  7e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  317  2e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  43.28 
 
 		 434 aa  317  2e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  44.03 
 
 		 436 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  44.59 
 
 		 432 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  46.63 
 
 		 449 aa  317  4e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  44.66 
 
 		 429 aa  316  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  316  5e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  45.36 
 
 		 445 aa  316  6e-85  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  44.85 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  44.85 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  45.99 
 
 		 435 aa  316  6e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  316  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  44.53 
 
 		 436 aa  315  7e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  315  8e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  42.62 
 
 		 439 aa  315  8e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  44.5 
 
 		 434 aa  315  9e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  41.26 
 
 		 433 aa  315  9.999999999999999e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  43.03 
 
 		 432 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  41.42 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  43.41 
 
 		 439 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  44.59 
 
 		 432 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  44.33 
 
 		 434 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  42.72 
 
 		 439 aa  313  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  44.59 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  44.59 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  44.59 
 
 		 432 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>