More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3944 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010086  Bmul_4126  phenylacetate-CoA ligase  69.23 
 
 		 440 aa  637    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.351473  normal  0.162313 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  71.98 
 
 		 448 aa  664    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  75.4 
 
 		 435 aa  687    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1318  phenylacetate-CoA ligase  69.7 
 
 		 440 aa  634    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.627542 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  100 
 
 		 439 aa  890    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  75.4 
 
 		 436 aa  685    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  78.13 
 
 		 436 aa  712    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  69.7 
 
 		 440 aa  639    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  77.9 
 
 		 434 aa  710    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  68.56 
 
 		 441 aa  634    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  77.01 
 
 		 439 aa  691    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3839  phenylacetate-CoA ligase  69.93 
 
 		 440 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0383671  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  69.7 
 
 		 440 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4529  phenylacetate-CoA ligase  69.93 
 
 		 440 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0652745  normal  0.906833 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5775  phenylacetate-CoA ligase  69.93 
 
 		 440 aa  635    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0374  phenylacetate-CoA ligase  66.74 
 
 		 441 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000302001  hitchhiker  0.00000497277 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3366  phenylacetate-CoA ligase  67.83 
 
 		 431 aa  619  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1392  phenylacetate-CoA ligase  68.46 
 
 		 441 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.276204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  67.98 
 
 		 432 aa  598  1e-170  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  68.07 
 
 		 434 aa  595  1e-169  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  68.07 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  66.9 
 
 		 434 aa  591  1e-168  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  67.21 
 
 		 432 aa  589  1e-167  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  67.98 
 
 		 432 aa  591  1e-167  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  67.9 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  67.52 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  67.44 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  67.52 
 
 		 432 aa  590  1e-167  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  65.21 
 
 		 436 aa  586  1e-166  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3279  phenylacetate-CoA ligase  67.13 
 
 		 439 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0901  phenylacetate-CoA ligase  65.74 
 
 		 445 aa  581  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  67.29 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2480  phenylacetate-CoA ligase  67.37 
 
 		 439 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  65.44 
 
 		 444 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2617  phenylacetate-CoA ligase  67.13 
 
 		 439 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.179563  normal  0.174416 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  66.12 
 
 		 434 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0440  phenylacetate-CoA ligase  64.98 
 
 		 436 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.908613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  66.74 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  66.98 
 
 		 432 aa  576  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  66.74 
 
 		 432 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  66.67 
 
 		 432 aa  577  1.0000000000000001e-163  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2630  phenylacetate-CoA ligase  67.13 
 
 		 439 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.460145  normal  0.0722332 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  66.51 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  65.51 
 
 		 443 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  66.12 
 
 		 436 aa  573  1.0000000000000001e-162  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  66.51 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  66.51 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  63.53 
 
 		 439 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5526  phenylacetate-CoA ligase  64.84 
 
 		 449 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0759485  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  66.51 
 
 		 432 aa  572  1.0000000000000001e-162  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1908  phenylacetate-CoA ligase  65.29 
 
 		 446 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.26463  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  63.72 
 
 		 434 aa  569  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0656  phenylacetate-CoA ligase  64.67 
 
 		 434 aa  569  1e-161  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2870  phenylacetate-CoA ligase  64.1 
 
 		 442 aa  570  1e-161  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.17832 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3096  phenylacetate-CoA ligase  63.51 
 
 		 439 aa  570  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0154139  hitchhiker  0.00102169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1515  phenylacetate-CoA ligase  64.87 
 
 		 438 aa  566  1e-160  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0837149  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  65.67 
 
 		 450 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  63.51 
 
 		 436 aa  561  1.0000000000000001e-159  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  63.82 
 
 		 443 aa  563  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2247  phenylacetate-CoA ligase  63.79 
 
 		 437 aa  559  1e-158  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0997438  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1584  phenylacetate-CoA ligase  63.79 
 
 		 437 aa  558  1e-158  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3634  phenylacetate-CoA ligase  63.99 
 
 		 444 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.521212 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1829  phenylacetate-CoA ligase  63.99 
 
 		 444 aa  560  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.914606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  62.56 
 
 		 434 aa  559  1e-158  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26570  phenylacetate-CoA ligase  64.06 
 
 		 448 aa  557  1e-157  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.123505 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1485  phenylacetate-CoA ligase  63.55 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2257  phenylacetate-CoA ligase  63.55 
 
 		 437 aa  557  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.253945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  63.47 
 
 		 433 aa  556  1e-157  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2189  phenylacetate-CoA ligase  63.11 
 
 		 434 aa  554  1e-156  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0357047  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3824  phenylacetate-CoA ligase  62.99 
 
 		 436 aa  554  1e-156  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0827131  normal  0.36821 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2034  phenylacetate-CoA ligase  63.05 
 
 		 437 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0258334 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1449  phenylacetate-CoA ligase  64.35 
 
 		 429 aa  535  1e-151  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0477  phenylacetate-CoA ligase  64.87 
 
 		 427 aa  534  1e-150  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  58.41 
 
 		 431 aa  533  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  58.93 
 
 		 435 aa  513  1e-144  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  59.63 
 
 		 449 aa  507  9.999999999999999e-143  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3048  phenylacetate-CoA ligase  57.18 
 
 		 456 aa  499  1e-140  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3247  phenylacetate-CoA ligase  57.7 
 
 		 444 aa  497  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  56.67 
 
 		 444 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  51.74 
 
 		 433 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  54.44 
 
 		 434 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  55.97 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  56.44 
 
 		 444 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  55.63 
 
 		 446 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  51.05 
 
 		 435 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  53.52 
 
 		 433 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  54.91 
 
 		 434 aa  462  1e-129  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  51.28 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  55.16 
 
 		 437 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  53.99 
 
 		 435 aa  460  9.999999999999999e-129  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  51.52 
 
 		 433 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  50.35 
 
 		 434 aa  456  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  51.52 
 
 		 435 aa  458  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  50.58 
 
 		 434 aa  454  1.0000000000000001e-126  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  50.12 
 
 		 434 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  51.99 
 
 		 433 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  51.41 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2322  Phenylacetate--CoA ligase  50.8 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  51.64 
 
 		 433 aa  442  1e-123  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  49.53 
 
 		 433 aa  443  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>