More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1878 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_1878  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 379 aa  759    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1284  AMP-dependent synthetase and ligase  77.84 
 
 		 383 aa  614  1e-175  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3795  coenzyme A ligase  35.52 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.14 
 
 		 438 aa  154  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  31.82 
 
 		 432 aa  145  1e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 432 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.25 
 
 		 436 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  28.76 
 
 		 430 aa  139  8.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0466  phenylacetate-CoA ligase  31.79 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.25 
 
 		 434 aa  138  1e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1585  Phenylacetate--CoA ligase  32.03 
 
 		 457 aa  137  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0730683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  28.8 
 
 		 433 aa  137  2e-31  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3490  phenylacetate-CoA ligase  31.15 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00352435  hitchhiker  0.000125806 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 434 aa  136  7.000000000000001e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  29.41 
 
 		 433 aa  135  9.999999999999999e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  31.27 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0444  phenylacetate-CoA ligase  31.97 
 
 		 432 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0469  phenylacetate-CoA ligase  31.69 
 
 		 432 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.119457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  28.76 
 
 		 433 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  26.33 
 
 		 425 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  29.52 
 
 		 431 aa  134  3e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2566  phenylacetate-CoA ligase  32.24 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0539  phenylacetate-CoA ligase  32.24 
 
 		 432 aa  134  3e-30  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.743587  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3117  phenylacetate-CoA ligase  30.71 
 
 		 434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0603128  normal  0.0548798 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2693  phenylacetate-CoA ligase  30.41 
 
 		 434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.666778  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  29.58 
 
 		 435 aa  133  3.9999999999999996e-30  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0040  Phenylacetate--CoA ligase  34.94 
 
 		 441 aa  133  3.9999999999999996e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.373743  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.7 
 
 		 434 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0052  Phenylacetate--CoA ligase  34.94 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2752  phenylacetate-CoA ligase  35.94 
 
 		 434 aa  133  5e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0185722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0036  phenylacetate-CoA ligase  34.7 
 
 		 441 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0511  phenylacetate-CoA ligase  31.97 
 
 		 432 aa  133  5e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.948349  normal  0.684224 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3626  phenylacetate-CoA ligase  31.42 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0611072  normal  0.539384 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2904  phenylacetate-CoA ligase  31.86 
 
 		 432 aa  133  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0773804  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  28.19 
 
 		 432 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  30.25 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  36.05 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.96 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  26.81 
 
 		 433 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  28.03 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  27.38 
 
 		 435 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2855  phenylacetate-CoA ligase  31.15 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.343301  normal  0.707193 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0539  phenylacetate-coenzyme A ligase  31.23 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0321632  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0935  phenylacetate-coenzyme A ligase  31.23 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3367  phenylacetate-CoA ligase  30.55 
 
 		 443 aa  130  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.322757  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  30.08 
 
 		 434 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  29.79 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1905  phenylacetate-coenzyme A ligase  31.23 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511484  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0638  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 432 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.100652  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  27.49 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  29.54 
 
 		 439 aa  130  4.0000000000000003e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  29.81 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2967  phenylacetate-CoA ligase  33.33 
 
 		 439 aa  130  5.0000000000000004e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  34.98 
 
 		 441 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.69 
 
 		 433 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  29.54 
 
 		 444 aa  129  6e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  29.62 
 
 		 446 aa  129  6e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3568  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.172482  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  33.47 
 
 		 444 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3550  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.489447  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3577  phenylacetate-CoA ligase  31.23 
 
 		 432 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.306139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  29.62 
 
 		 432 aa  129  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  35.85 
 
 		 442 aa  129  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  29.71 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  30.43 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2875  phenylacetyl-CoA-ligase protein  30.79 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0228707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  30.91 
 
 		 428 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  28.96 
 
 		 430 aa  127  3e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  26.07 
 
 		 429 aa  127  3e-28  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  26.46 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  26.35 
 
 		 423 aa  127  3e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  33.66 
 
 		 436 aa  127  3e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0809  phenylacetate-CoA ligase  30.47 
 
 		 439 aa  127  4.0000000000000003e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.693616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  25.82 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1236  phenylacetate-CoA ligase  29.1 
 
 		 436 aa  126  5e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3741  phenylacetate-CoA ligase  33.45 
 
 		 448 aa  126  5e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.1455  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  28.43 
 
 		 432 aa  126  5e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  27.57 
 
 		 439 aa  126  7e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1976  phenylacetate-CoA ligase  32.26 
 
 		 437 aa  126  7e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1509  phenylacetate-CoA ligase  31.9 
 
 		 441 aa  126  8.000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.047551  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0986  phenylacetate-CoA ligase  29.59 
 
 		 435 aa  125  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.337709  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  26.02 
 
 		 434 aa  125  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3944  phenylacetate-CoA ligase  29.28 
 
 		 439 aa  125  2e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.8736  normal  0.632823 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  28.88 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2486  phenylacetate-CoA ligase  33.57 
 
 		 450 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0773414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6182  phenylacetate-CoA ligase  31.88 
 
 		 435 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  27.03 
 
 		 439 aa  124  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  28.78 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4422  phenylacetate-CoA ligase  32.37 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  33.86 
 
 		 446 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  26.6 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2403  phenylacetate-CoA ligase  33.98 
 
 		 436 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.670369 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3959  phenylacetate-CoA ligase  32.39 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.349382  normal  0.520429 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.99 
 
 		 432 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  31.91 
 
 		 436 aa  124  4e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1923  phenylacetate-CoA ligase  32.98 
 
 		 443 aa  123  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0702505  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  27.18 
 
 		 433 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  31.69 
 
 		 444 aa  122  7e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>