263 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_13008 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  100 
 
 		 463 aa  942    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  28.45 
 
 		 458 aa  190  4e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  27.86 
 
 		 446 aa  188  1e-46  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  26.59 
 
 		 453 aa  181  2e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.37 
 
 		 466 aa  172  1e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.42 
 
 		 475 aa  169  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  24.16 
 
 		 448 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  24.43 
 
 		 464 aa  157  3e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  24.09 
 
 		 461 aa  156  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  24.89 
 
 		 475 aa  156  9e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.76 
 
 		 437 aa  151  3e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  22.37 
 
 		 450 aa  147  3e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  23.98 
 
 		 451 aa  147  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  25.06 
 
 		 469 aa  145  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  24.07 
 
 		 453 aa  143  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.23 
 
 		 450 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.25 
 
 		 454 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  24.89 
 
 		 445 aa  140  4.999999999999999e-32  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  24.2 
 
 		 437 aa  140  6e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  27.58 
 
 		 446 aa  139  1e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  22.69 
 
 		 457 aa  139  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  25.99 
 
 		 441 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.23 
 
 		 439 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  24.43 
 
 		 416 aa  132  2.0000000000000002e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  22.16 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  23.02 
 
 		 480 aa  128  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  21.86 
 
 		 461 aa  126  7e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  24.75 
 
 		 453 aa  122  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  26.41 
 
 		 468 aa  118  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  22.66 
 
 		 446 aa  116  6.9999999999999995e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  26.04 
 
 		 417 aa  115  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  25.91 
 
 		 467 aa  114  5e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.99 
 
 		 563 aa  109  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  25 
 
 		 426 aa  107  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.54 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  24.38 
 
 		 481 aa  100  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  24.31 
 
 		 460 aa  98.6  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  26.64 
 
 		 476 aa  94.4  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  22.28 
 
 		 456 aa  94.4  4e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  21.17 
 
 		 448 aa  94  5e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  25 
 
 		 436 aa  94  6e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  22.6 
 
 		 448 aa  93.6  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.74 
 
 		 448 aa  93.2  9e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1075  phenylacetate--CoA ligase  24.47 
 
 		 429 aa  92.8  1e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.24 
 
 		 457 aa  91.7  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  25 
 
 		 459 aa  92.4  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3190  phenylacetate--CoA ligase  26.29 
 
 		 432 aa  91.3  3e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0586807  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  23.29 
 
 		 479 aa  89.7  1e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.81 
 
 		 436 aa  88.6  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  25.52 
 
 		 361 aa  87.4  5e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.98 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0133  Phenylacetate--CoA ligase  23.05 
 
 		 436 aa  85.5  0.000000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0426675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.31 
 
 		 268 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3276  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.57 
 
 		 417 aa  84  0.000000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  24.69 
 
 		 433 aa  83.6  0.000000000000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.68 
 
 		 460 aa  81.3  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03810  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.62 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.27 
 
 		 480 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  22.22 
 
 		 472 aa  78.6  0.0000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1004  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.77 
 
 		 442 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3406  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.93 
 
 		 478 aa  78.2  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.684455  normal  0.102946 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1800  coenzyme F390 synthetase-like  20.6 
 
 		 450 aa  78.2  0.0000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0238175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  24.32 
 
 		 433 aa  77.4  0.0000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  23.38 
 
 		 428 aa  77  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  20.64 
 
 		 502 aa  76.6  0.0000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  23.95 
 
 		 433 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.53 
 
 		 480 aa  75.5  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  24.71 
 
 		 433 aa  74.7  0.000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  24.27 
 
 		 487 aa  74.3  0.000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.88 
 
 		 467 aa  74.3  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  26.72 
 
 		 438 aa  73.9  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  23.19 
 
 		 466 aa  73.9  0.000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  24.66 
 
 		 433 aa  73.9  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  27.51 
 
 		 435 aa  73.9  0.000000000005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.22 
 
 		 432 aa  73.6  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  23.84 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  23.45 
 
 		 433 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  24.18 
 
 		 435 aa  72.4  0.00000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  20.19 
 
 		 454 aa  71.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0807  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.78 
 
 		 452 aa  71.2  0.00000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.316461  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  24.53 
 
 		 415 aa  71.6  0.00000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5790  phenylacetate--CoA ligase  24.22 
 
 		 416 aa  71.2  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  21.19 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  23.36 
 
 		 462 aa  70.1  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  24.88 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  25.93 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  25.59 
 
 		 433 aa  69.7  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  24.4 
 
 		 434 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  22.19 
 
 		 434 aa  68.9  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  22.63 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  23.23 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2125  phenylacetate-CoA ligase  23.05 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  23.86 
 
 		 434 aa  68.6  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1132  Phenylacetate--CoA ligase  25.07 
 
 		 418 aa  68.9  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 431 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  23.93 
 
 		 473 aa  68.2  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  31.85 
 
 		 436 aa  67.8  0.0000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  22.43 
 
 		 434 aa  67.8  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  23.68 
 
 		 446 aa  67.8  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4311  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.79 
 
 		 454 aa  67.4  0.0000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0828925  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>