More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3669 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  100 
 
 		 473 aa  968    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1038  hypothetical protein  41.58 
 
 		 471 aa  296  6e-79  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.888049  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0627  coenzyme F390 synthetase  36.38 
 
 		 448 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3322  hypothetical protein  38.05 
 
 		 445 aa  237  3e-61  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.985105  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  29.02 
 
 		 434 aa  137  5e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  29.37 
 
 		 438 aa  135  1.9999999999999998e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  28.03 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  28.38 
 
 		 435 aa  134  3e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  27.79 
 
 		 445 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  27.71 
 
 		 445 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  26.56 
 
 		 434 aa  131  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  27.34 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  27.61 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  28.32 
 
 		 430 aa  129  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  27.48 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0559  Phenylacetate--CoA ligase  29.08 
 
 		 434 aa  127  3e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.589341  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  28.15 
 
 		 429 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.13 
 
 		 452 aa  127  6e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 447 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  27.21 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 434 aa  124  2e-27  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2986  phenylacetate-CoA ligase  29.06 
 
 		 435 aa  124  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.199718  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  29.16 
 
 		 458 aa  124  4e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  28.12 
 
 		 427 aa  124  4e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0797  Phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  27.32 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  26.99 
 
 		 430 aa  123  6e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 432 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  26.44 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  26.59 
 
 		 437 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  27.39 
 
 		 423 aa  122  9.999999999999999e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1578  Phenylacetate--CoA ligase  27.75 
 
 		 436 aa  121  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.198004 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  24.89 
 
 		 439 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  25.93 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  25.9 
 
 		 435 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  27.06 
 
 		 435 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  25.5 
 
 		 432 aa  120  6e-26  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  25 
 
 		 435 aa  120  6e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  25.87 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  25.97 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  27.46 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  27.98 
 
 		 433 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  26.09 
 
 		 432 aa  119  7.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  25.91 
 
 		 428 aa  119  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  26.55 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0929  phenylacetate-coenzyme A ligase (phenylacetyl-CoA ligase) (PA-CoA ligase)  50.43 
 
 		 129 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  26.82 
 
 		 413 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  26.53 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  25.91 
 
 		 433 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  25.7 
 
 		 435 aa  117  3e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  30.68 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  24.94 
 
 		 434 aa  117  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  26.08 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0933  phenylacetate-CoA ligase  25.75 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27480  phenylacetate-CoA ligase  28.84 
 
 		 412 aa  116  7.999999999999999e-25  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0513  phenylacetate-CoA ligase  24.5 
 
 		 432 aa  116  8.999999999999998e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.62 
 
 		 431 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0060  Phenylacetate--CoA ligase  28.69 
 
 		 413 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  24.49 
 
 		 439 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  25.17 
 
 		 434 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.66 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  23.41 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  23.97 
 
 		 439 aa  114  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  27.7 
 
 		 432 aa  114  3e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02550  phenylacetate-CoA ligase  30.27 
 
 		 412 aa  114  3e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.856632  hitchhiker  0.000124946 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  26.26 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  28.57 
 
 		 444 aa  114  5e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  25.81 
 
 		 433 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  25.87 
 
 		 441 aa  113  6e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0637  phenylacetate--CoA ligase  27.81 
 
 		 414 aa  113  6e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  28.01 
 
 		 444 aa  114  6e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  25 
 
 		 433 aa  113  8.000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4008  phenylacetate--CoA ligase  26.85 
 
 		 444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  27.54 
 
 		 414 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  26.56 
 
 		 446 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1968  phenylacetate-CoA ligase  25.57 
 
 		 433 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  26.45 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0950  phenylacetate-CoA ligase  26.25 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000041107  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  26.92 
 
 		 444 aa  111  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1360  phenylacetate-CoA ligase  27.47 
 
 		 414 aa  111  3e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.292224  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  28.68 
 
 		 428 aa  111  4.0000000000000004e-23  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  24.94 
 
 		 434 aa  110  4.0000000000000004e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  26.11 
 
 		 429 aa  110  5e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0039  phenylacetate--CoA ligase  30.07 
 
 		 441 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.728722  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1325  phenylacetate--CoA ligase  26.79 
 
 		 415 aa  110  7.000000000000001e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.878403  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  28.97 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0437  Phenylacetate--CoA ligase  27.78 
 
 		 435 aa  109  1e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288534  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  27.23 
 
 		 432 aa  109  1e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  25.89 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1000  Phenylacetate--CoA ligase  26.98 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.354493  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1010  Phenylacetate--CoA ligase  29.07 
 
 		 415 aa  108  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.45626  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0054  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 441 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  25.77 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0042  Phenylacetate--CoA ligase  27.02 
 
 		 441 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0070  phenylacetate--CoA ligase  26.67 
 
 		 445 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  23.58 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0570  phenylacetate-CoA ligase  26.88 
 
 		 434 aa  107  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.419756  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>