More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_1511 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_1511  CoA ligase  100 
 
 		 437 aa  879    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.42571  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3269  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  37.19 
 
 		 457 aa  256  5e-67  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0135  CoA ligase  37.67 
 
 		 450 aa  252  7e-66  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2519  AMP-dependent synthetase and ligase  36.87 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.37468  normal  0.0166994 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2411  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  34.16 
 
 		 451 aa  239  1e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1971  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  35.21 
 
 		 453 aa  237  4e-61  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0676  putative CapK protein  33.63 
 
 		 459 aa  237  4e-61  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0499803  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0295  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  36.83 
 
 		 461 aa  230  3e-59  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.619099  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0291  capsular polysaccharide biosynthesis protein CapK  35.86 
 
 		 453 aa  224  3e-57  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.326701  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1793  putative CapK protein  35.35 
 
 		 441 aa  194  2e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0614  CapK related-protein  33.26 
 
 		 445 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.973847  normal  0.145617 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.06 
 
 		 454 aa  187  5e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1800  putative polysaccharide biosynthesis protein  29.47 
 
 		 448 aa  169  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5015  putative polysaccharide biosynthesis protein  25.33 
 
 		 446 aa  167  4e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0449  putative capK protein  28.33 
 
 		 446 aa  164  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1955  capK related-protein  29.28 
 
 		 453 aa  162  9e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3567  CapK related-protein  32.36 
 
 		 502 aa  161  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  29.48 
 
 		 475 aa  156  6e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2205  Coenzyme F390 synthetase-like protein  28.92 
 
 		 439 aa  153  5.9999999999999996e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3882  CapK related-protein  27.74 
 
 		 480 aa  152  2e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.103284  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2311  capsular polysaccharide biosynthesis protein, putative  28.26 
 
 		 464 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0836  CapK related-protein  30.55 
 
 		 469 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2526  Coenzyme F390 synthetase-like protein  24.21 
 
 		 437 aa  146  6e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000142234 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2316  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.54 
 
 		 450 aa  145  1e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2647  coenzyme F390 synthetase-like  27.84 
 
 		 467 aa  142  8e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  30.73 
 
 		 461 aa  141  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0689  CapK related-protein  27.66 
 
 		 426 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0582136  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13008  possible CapK protein  24.2 
 
 		 463 aa  140  6e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0922559  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1040  coenzyme F390 synthetase-like protein  24.24 
 
 		 436 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  28.15 
 
 		 416 aa  130  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2454  coenzyme F390 synthetase  25.56 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1943  hypothetical protein  26.82 
 
 		 460 aa  124  3e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3795  CapK protein, putative  26.98 
 
 		 475 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.217638  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0387  Coenzyme F390 synthetase-like protein  27.25 
 
 		 466 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.602394  normal  0.432377 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1950  capK related-protein  27.27 
 
 		 446 aa  103  7e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2429  capK domain protein  25.24 
 
 		 476 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00799946  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02970  possible capK protein  25.99 
 
 		 435 aa  102  1e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.240993  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2299  hypothetical protein  24.84 
 
 		 448 aa  99.4  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0875  Coenzyme F390 synthetase-like protein  23.62 
 
 		 563 aa  98.6  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1814  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.96 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2239  coenzyme F390 synthetase-like  27.08 
 
 		 466 aa  95.9  1e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.93 
 
 		 461 aa  94.4  3e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0582  hypothetical protein  25.68 
 
 		 479 aa  92.8  1e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.661178  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4305  CapK domain-containing protein  25 
 
 		 481 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0698086  normal  0.901449 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  26.4 
 
 		 457 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  24.41 
 
 		 361 aa  86.7  7e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0016  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.7 
 
 		 480 aa  86.3  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0110032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.94 
 
 		 459 aa  85.1  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1615  Coenzyme F390 synthetase-like protein  29.12 
 
 		 461 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1703  coenzyme F390 synthetase  23.7 
 
 		 472 aa  82.4  0.00000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4216  coenzyme F390 synthetase-like  25.95 
 
 		 456 aa  82.8  0.00000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6630  hypothetical protein  35.51 
 
 		 462 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.997054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0472  putative capK protein  19.36 
 
 		 459 aa  82  0.00000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000021402  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1200  hypothetical protein  24.18 
 
 		 448 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0277555  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00696  hypothetical protein  21.85 
 
 		 417 aa  80.5  0.00000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  37.11 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2997  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.36 
 
 		 468 aa  79.7  0.00000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0662  Coenzyme F390 synthetase-like protein  25.98 
 
 		 425 aa  79.7  0.0000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  27.27 
 
 		 438 aa  78.6  0.0000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1580  AMP-binding protein  36.99 
 
 		 449 aa  77  0.0000000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0910  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.86 
 
 		 436 aa  77  0.0000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  24.35 
 
 		 435 aa  76.6  0.0000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3669  coenzyme F390 synthetase  31.54 
 
 		 473 aa  76.6  0.0000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.887381  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1798  Phenylacetate--CoA ligase  32.26 
 
 		 427 aa  75.1  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2007  CapK related-protein  23.62 
 
 		 487 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3212  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.38 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  25.88 
 
 		 431 aa  73.2  0.000000000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0226  coenzyme F390 synthetase  30.72 
 
 		 454 aa  72.4  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1546  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.76 
 
 		 443 aa  72.8  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0441  capsular polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 468 aa  70.5  0.00000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.356155  normal  0.0209256 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0627  coenzyme F390 synthetase  29.38 
 
 		 448 aa  69.7  0.00000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  30.96 
 
 		 425 aa  69.7  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  31.16 
 
 		 433 aa  68.6  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  24.64 
 
 		 428 aa  68.2  0.0000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2010  coenzyme F390 synthetase-like protein  23.93 
 
 		 455 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.484811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2614  coenzyme F390 synthetase-like protein  31.55 
 
 		 377 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.38 
 
 		 452 aa  67  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  27.59 
 
 		 433 aa  67  0.0000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0388  phenylacetate-CoA ligase  26.82 
 
 		 427 aa  67  0.0000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.128203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  26.75 
 
 		 447 aa  66.6  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3613  coenzyme F390 synthetase  26.55 
 
 		 436 aa  66.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0420369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06240  phenylacetate-CoA ligase  27.66 
 
 		 436 aa  65.9  0.000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.57467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1392  coenzyme F390 synthetase  21.33 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000346033  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3434  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.03 
 
 		 467 aa  65.5  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  23.15 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0571  phenylacetate--CoA ligase  28.11 
 
 		 432 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3014  hypothetical protein  26.06 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  30.66 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0042  Phenylacetate--CoA ligase  22.73 
 
 		 432 aa  64.7  0.000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.125903 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3246  hypothetical protein  26.06 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0811  Phenylacetate--CoA ligase  23.57 
 
 		 442 aa  64.7  0.000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  29.87 
 
 		 433 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  25.63 
 
 		 440 aa  64.7  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  27.04 
 
 		 434 aa  64.7  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3245  hypothetical protein  26.06 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  26.67 
 
 		 445 aa  64.7  0.000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  26.06 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  26.06 
 
 		 445 aa  64.3  0.000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4415  coenzyme F390 synthetase-like protein  26.68 
 
 		 480 aa  64.7  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.992937  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1316  phenylacetate--CoA ligase  29.55 
 
 		 414 aa  64.3  0.000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>