More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_1303 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_1303  Phenylacetate--CoA ligase  100 
 
 		 437 aa  899    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2310  Phenylacetate--CoA ligase  46.13 
 
 		 425 aa  345  1e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2152  Phenylacetate--CoA ligase  38.6 
 
 		 446 aa  271  1e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.65736  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0790  phenylacetate--CoA ligase  35.47 
 
 		 458 aa  205  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1613  Phenylacetate--CoA ligase  33.86 
 
 		 445 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.297864  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2792  phenylacetate--CoA ligase  32.18 
 
 		 440 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3222  phenylacetate--CoA ligase  33.59 
 
 		 445 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0561  phenylacetate--CoA ligase  32.7 
 
 		 447 aa  197  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2192  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 		 434 aa  191  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.724395  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1569  coenzyme F390 synthetase  32.28 
 
 		 433 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.645557  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3655  phenylacetate--CoA ligase  30.36 
 
 		 481 aa  189  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.174425 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0169  phenylacetate--CoA ligase  31.93 
 
 		 433 aa  189  9e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1825  phenylacetate-CoA ligase  32.05 
 
 		 435 aa  188  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1625  phenylacetate--CoA ligase  32.79 
 
 		 429 aa  189  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314491  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2035  Phenylacetate--CoA ligase  31.12 
 
 		 434 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000365841 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0790  phenylacetate--CoA ligase  30.82 
 
 		 433 aa  187  4e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.740022  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1507  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 433 aa  186  6e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0260  phenylacetate--CoA ligase  32.18 
 
 		 434 aa  186  8e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.108553  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1858  Phenylacetate--CoA ligase  32.71 
 
 		 435 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00363139  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1504  Phenylacetate--CoA ligase  32.12 
 
 		 433 aa  186  1.0000000000000001e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1737  phenylacetate-CoA ligase  31.58 
 
 		 435 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.102545  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0750  phenylacetate--CoA ligase  31.74 
 
 		 429 aa  184  3e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.564813  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1742  phenylacetate--CoA ligase  30.37 
 
 		 432 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.287077 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2129  phenylacetate--CoA ligase  29.16 
 
 		 472 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1165  phenylacetate--CoA ligase  31.15 
 
 		 433 aa  182  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0169  phenylacetate--CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  181  2e-44  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.419801  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1515  phenylacetate-CoA ligase  30.59 
 
 		 433 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.049443  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1385  Phenylacetate--CoA ligase  33.18 
 
 		 434 aa  180  4e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741433 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1160  phenylacetate--CoA ligase  30.82 
 
 		 433 aa  180  4.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.580282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0861  phenylacetate-CoA ligase  30.14 
 
 		 432 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.354506  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0339  phenylacetate-CoA ligase  29.91 
 
 		 433 aa  179  9e-44  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1457  phenylacetate-CoA ligase  30.94 
 
 		 428 aa  179  9e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.387558 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1590  phenylacetate--CoA ligase  30.59 
 
 		 432 aa  178  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1669  phenylacetate--CoA ligase  30.65 
 
 		 433 aa  176  7e-43  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0710  phenylacetate--CoA ligase  30.41 
 
 		 423 aa  176  9e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0777272 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1624  phenylacetate--CoA ligase  31.07 
 
 		 433 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.962242 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2124  Phenylacetate--CoA ligase  30.96 
 
 		 430 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0633  phenylacetate--CoA ligase  30.98 
 
 		 432 aa  175  1.9999999999999998e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.683184  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0163  Phenylacetate--CoA ligase  32.35 
 
 		 438 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0709  phenylacetate--CoA ligase  32.14 
 
 		 433 aa  174  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0797552 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2124  phenylacetate--CoA ligase  30.57 
 
 		 434 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1826  Phenylacetate--CoA ligase  29.68 
 
 		 430 aa  174  3.9999999999999995e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2133  phenylacetate--CoA ligase  30 
 
 		 434 aa  173  5e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00349267  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1573  phenylacetate--CoA ligase  31.51 
 
 		 431 aa  173  6.999999999999999e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2432  Phenylacetate--CoA ligase  31.25 
 
 		 428 aa  172  9e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.028462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1218  phenylacetate-CoA ligase  29.2 
 
 		 436 aa  172  9e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5019  phenylacetate--CoA ligase  28.21 
 
 		 477 aa  172  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.173124  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0669  phenylacetate-CoA ligase  30.05 
 
 		 433 aa  171  2e-41  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.73594  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0539  phenylacetate--CoA ligase  27 
 
 		 477 aa  171  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  decreased coverage  0.00138843 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2884  phenylacetate--CoA ligase  31.81 
 
 		 434 aa  171  3e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00316572  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3083  phenylacetate--CoA ligase  28.57 
 
 		 423 aa  170  4e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1754  phenylacetate--CoA ligase  29.82 
 
 		 435 aa  170  6e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0384873  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1910  Phenylacetate--CoA ligase  31.18 
 
 		 436 aa  169  1e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000190319  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3017  phenylacetate-CoA ligase  30.93 
 
 		 434 aa  168  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1320  coenzyme F390 synthetase  29.36 
 
 		 436 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2323  phenylacetate--CoA ligase  30.45 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1015  phenylacetate-CoA ligase  30.45 
 
 		 439 aa  167  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2123  Phenylacetate--CoA ligase  30.79 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1456  phenylacetate-CoA ligase  29.29 
 
 		 433 aa  167  4e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.386345 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1729  phenylacetate-CoA ligase  30 
 
 		 433 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2278  phenylacetate-CoA ligase  31.97 
 
 		 430 aa  166  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.129528  hitchhiker  0.0000241897 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_886  acyl-CoA synthetase (AMP-forming) / AMP-acid ligase  31.14 
 
 		 439 aa  166  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0749  phenylacetate--CoA ligase  29.59 
 
 		 433 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0461279  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3165  phenylacetate-CoA ligase  29.91 
 
 		 434 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0404023  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1756  phenylacetate--CoA ligase  31.74 
 
 		 432 aa  164  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1519  phenylacetate--CoA ligase  30.3 
 
 		 435 aa  164  3e-39  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00322387 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0902  phenylacetate-CoA ligase  30.91 
 
 		 439 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0972  phenylacetate-CoA ligase  29.19 
 
 		 432 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1422  Phenylacetate--CoA ligase  29.64 
 
 		 444 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.393229  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0615  phenylacetate-CoA ligase  30.43 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.893262  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1683  phenylacetate--CoA ligase  31.17 
 
 		 433 aa  164  4.0000000000000004e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1139  Phenylacetate--CoA ligase  30.28 
 
 		 435 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000376262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4801  phenylacetate-CoA ligase  30.25 
 
 		 436 aa  163  5.0000000000000005e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.12484  normal  0.238866 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3091  phenylacetate--CoA ligase  31.35 
 
 		 437 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000125462  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0660  phenylacetate-CoA ligase  28.18 
 
 		 431 aa  162  8.000000000000001e-39  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2184  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13410  phenylacetate-CoA ligase  30.34 
 
 		 435 aa  162  1e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2043  phenylacetate-CoA ligase  29.68 
 
 		 433 aa  162  1e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000158285 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2870  phenylacetate-CoA ligase  30.39 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0939  Phenylacetate--CoA ligase  31.72 
 
 		 432 aa  162  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1818  phenylacetate-CoA ligase  30.24 
 
 		 433 aa  161  2e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0207  phenylacetate-CoA ligase  29.98 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0211  phenylacetate-CoA ligase  29.72 
 
 		 434 aa  160  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.40287  normal  0.756152 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0815  phenylacetate--CoA ligase  31.14 
 
 		 439 aa  159  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.180698  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08400  coenzyme F390 synthetase  28.51 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0324519  normal  0.311069 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1237  phenylacetate--CoA ligase  29.03 
 
 		 444 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0073  Phenylacetate--CoA ligase  29.22 
 
 		 433 aa  157  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3082  phenylacetate-CoA ligase  30.11 
 
 		 436 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.6719  normal  0.443778 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0227  phenylacetate-CoA ligase  30.09 
 
 		 433 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0166  Phenylacetate--CoA ligase  32.41 
 
 		 432 aa  157  2e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1153  Phenylacetate--CoA ligase  30.52 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.107215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0442  Phenylacetate--CoA ligase  29.61 
 
 		 434 aa  158  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.372138 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0066  phenylacetate--CoA ligase  29.77 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.922632  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4320  phenylacetate--CoA ligase  30.02 
 
 		 444 aa  157  3e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0409  Phenylacetate--CoA ligase  28.54 
 
 		 447 aa  157  3e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0103532 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1574  phenylacetate--CoA ligase  29.5 
 
 		 441 aa  157  5.0000000000000005e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.888855  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2084  phenylacetate-CoA ligase  29.38 
 
 		 433 aa  156  6e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.268641  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0698  phenylacetate--CoA ligase  30.23 
 
 		 446 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.70972  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0683  phenylacetate-CoA ligase  30.68 
 
 		 444 aa  155  1e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0075  Phenylacetate--CoA ligase  28.47 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>