33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0371 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0371  indoleacetate-lysine ligase  100 
 
 		 395 aa  818    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6699  indoleacetate--lysine ligase  29.46 
 
 		 411 aa  146  6e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.43537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2035  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.1 
 
 		 454 aa  62.8  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1925  hypothetical protein  28.11 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.132933  normal  0.100536 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1926  acyl-CoA reductase  25.1 
 
 		 837 aa  58.9  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.318722  normal  0.240378 
 
 
-
 
NC_002950  PG0111  capsular polysacharride biosynthesis gene, putative  26.76 
 
 		 422 aa  57  0.0000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000821148 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2897  Phenylacetate--CoA ligase  27.27 
 
 		 428 aa  55.5  0.000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1652  coenzyme F390 synthetase-like  30.83 
 
 		 361 aa  55.5  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.410876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3140  hypothetical protein  26.58 
 
 		 447 aa  53.5  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0379  phenylacetate--CoA ligase  25.69 
 
 		 432 aa  52  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.69725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2557  phenylacetate-CoA ligase  26.6 
 
 		 390 aa  50.4  0.00005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.766488 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3545  coenzyme F390 synthetase-like  24.18 
 
 		 524 aa  49.7  0.00009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1132  hypothetical protein  24.04 
 
 		 498 aa  48.5  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.469412  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4420  adenylate-forming enzyme  22.91 
 
 		 428 aa  48.9  0.0002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2955  putative adenylate-forming enzyme  28.09 
 
 		 445 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0260622  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2310  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.45 
 
 		 475 aa  47.8  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1535  CapK protein, putative  23.3 
 
 		 461 aa  47.4  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4139  adenylate-forming enzyme  22.63 
 
 		 428 aa  47  0.0005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3373  hypothetical protein  22.61 
 
 		 406 aa  47.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1027  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  26.23 
 
 		 560 aa  46.6  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.729958  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4201  coenzyme F390 synthetase-like  22.22 
 
 		 457 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.282456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0508  coenzyme F390 synthetase  25.15 
 
 		 455 aa  45.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4394  coenzyme F390 synthetase-like protein  28.15 
 
 		 268 aa  45.4  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3332  coenzyme F390 synthetase-like  24.9 
 
 		 416 aa  45.1  0.002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.422547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1074  coenzyme F390 synthetase-like protein  27.54 
 
 		 461 aa  45.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.733782  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2936  hypothetical protein  27.66 
 
 		 445 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2999  coenzyme F390 synthetase  27.66 
 
 		 445 aa  45.1  0.002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0176304  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0799  putative acyl-CoA synthetase  26.29 
 
 		 546 aa  44.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0930157  normal  0.263269 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2156  coenzyme F390 synthetase-like protein  25.95 
 
 		 459 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.295514  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1029  Phenylacetate--CoA ligase  26.25 
 
 		 429 aa  44.3  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2016  coenzyme F390 synthetase-like protein  22.7 
 
 		 452 aa  43.9  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.651292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3400  AMP-dependent synthetase and ligase  26.15 
 
 		 1083 aa  43.5  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.371233 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20330  phenylacetate-CoA ligase  23.48 
 
 		 449 aa  42.7  0.01  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>