94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0110 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 145 aa  299  8.000000000000001e-81  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  81.51 
 
 		 121 aa  207  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  78.15 
 
 		 139 aa  202  2e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  77.87 
 
 		 134 aa  201  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  78.33 
 
 		 125 aa  197  5e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  78.45 
 
 		 122 aa  195  2.0000000000000003e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  76.07 
 
 		 123 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  77.59 
 
 		 122 aa  193  7e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  78.95 
 
 		 122 aa  193  8.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  78.07 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  78.07 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  76.72 
 
 		 122 aa  192  2e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  77.19 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  77.19 
 
 		 122 aa  191  3e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  67.23 
 
 		 121 aa  179  1e-44  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  77.19 
 
 		 122 aa  165  2e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  38.94 
 
 		 159 aa  97.1  8e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  39.66 
 
 		 127 aa  95.1  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  35.48 
 
 		 131 aa  92.4  2e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 127 aa  89  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  38.66 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  35.34 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  34.48 
 
 		 121 aa  85.1  3e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  37.93 
 
 		 125 aa  84.7  4e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  39.66 
 
 		 117 aa  84.3  5e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  41.05 
 
 		 129 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  40.86 
 
 		 129 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  36.75 
 
 		 136 aa  82  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  41.07 
 
 		 111 aa  81.3  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  32.26 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  30.51 
 
 		 126 aa  78.6  0.00000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 111 aa  78.6  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  36.45 
 
 		 123 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  30.58 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  45 
 
 		 121 aa  71.2  0.000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  34.38 
 
 		 114 aa  70.5  0.000000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  27.01 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  43.37 
 
 		 149 aa  67  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  32.28 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  33.98 
 
 		 132 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 		 127 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  38.32 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  28.45 
 
 		 134 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  38.32 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  37.38 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  37.38 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  40.19 
 
 		 123 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  30.69 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  31.25 
 
 		 134 aa  57.8  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  30.69 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  30.69 
 
 		 135 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  30.61 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  34.07 
 
 		 131 aa  54.7  0.0000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  31.43 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  32.38 
 
 		 130 aa  54.3  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  33.98 
 
 		 131 aa  52.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 119 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  30.53 
 
 		 126 aa  52  0.000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  33.73 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  38.64 
 
 		 136 aa  51.2  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  35.29 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.56 
 
 		 130 aa  50.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  31.96 
 
 		 113 aa  50.4  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 		 133 aa  50.1  0.00001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  32.79 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  31.93 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  31.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  31.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  31.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  31.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  31.93 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  31.93 
 
 		 134 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  31.15 
 
 		 145 aa  47.4  0.00006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  31.25 
 
 		 124 aa  47.4  0.00006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  29.87 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  31.36 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 		 126 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 		 116 aa  44.3  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 130 aa  43.9  0.0008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  32.2 
 
 		 144 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  25.25 
 
 		 124 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  35.8 
 
 		 143 aa  40.8  0.007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>