71 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03961 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 159 aa  326  9e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  65.25 
 
 		 131 aa  166  9e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  47.86 
 
 		 127 aa  121  5e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  38.66 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  38.66 
 
 		 122 aa  104  4e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  38.66 
 
 		 122 aa  104  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 134 aa  102  2e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  36.97 
 
 		 122 aa  101  4e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 122 aa  99  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 122 aa  98.6  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  35.9 
 
 		 125 aa  98.2  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  38.94 
 
 		 145 aa  97.1  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  37.17 
 
 		 121 aa  96.7  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  37.17 
 
 		 139 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  36.28 
 
 		 123 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  35.65 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  38.33 
 
 		 121 aa  91.3  5e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  44 
 
 		 129 aa  88.6  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  40.16 
 
 		 125 aa  87.8  6e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  34.75 
 
 		 125 aa  87  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  36.13 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  42 
 
 		 129 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  36.51 
 
 		 127 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  37.82 
 
 		 122 aa  84  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  35.9 
 
 		 128 aa  79  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  34.19 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 117 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  34.19 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  33.06 
 
 		 126 aa  72.8  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  37.72 
 
 		 111 aa  71.2  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  35.96 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.03 
 
 		 135 aa  70.5  0.00000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  30.83 
 
 		 136 aa  68.9  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  33.05 
 
 		 125 aa  68.2  0.00000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  38.89 
 
 		 123 aa  67.8  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  29.77 
 
 		 149 aa  62.4  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  31.18 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  28.85 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  28.91 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.25 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  28.85 
 
 		 125 aa  56.6  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  33.02 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 		 136 aa  53.5  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  31.25 
 
 		 134 aa  53.5  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 		 132 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  27.68 
 
 		 130 aa  52.4  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 		 123 aa  50.8  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  32.32 
 
 		 135 aa  49.7  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  39.81 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  39.81 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  32.04 
 
 		 131 aa  49.7  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  28.7 
 
 		 146 aa  49.7  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  36.36 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  39.81 
 
 		 123 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  28.92 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 144 aa  47  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 		 125 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  29 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  30.61 
 
 		 132 aa  44.7  0.0006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  25.41 
 
 		 126 aa  44.7  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  26.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  26.73 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0324  general secretion pathway protein I, putative  30.43 
 
 		 118 aa  42.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  37.04 
 
 		 123 aa  42.4  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>