48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0957 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 114 aa  228  2e-59  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  100 
 
 		 96 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3265  general secretion pathway protein I  91.14 
 
 		 79 aa  150  5e-36  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472125  hitchhiker  0.00000000000000289406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  33.03 
 
 		 125 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  32.46 
 
 		 128 aa  77  0.00000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  33.9 
 
 		 139 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  28.44 
 
 		 121 aa  72  0.000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  33 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  34.38 
 
 		 145 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  27.43 
 
 		 126 aa  67.4  0.00000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  35.42 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 		 123 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  30.7 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 		 122 aa  63.5  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 		 117 aa  63.2  0.000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  32.35 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 122 aa  62.8  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 134 aa  62  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  29.7 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  31.18 
 
 		 159 aa  58.5  0.00000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  27.03 
 
 		 111 aa  58.2  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  29.81 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  30.3 
 
 		 128 aa  57.8  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  35.53 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  23.64 
 
 		 125 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  26.55 
 
 		 111 aa  53.5  0.0000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  29.17 
 
 		 129 aa  52  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  28.12 
 
 		 129 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  24.51 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  31.73 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  31.73 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  30.77 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  30.77 
 
 		 123 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  34.41 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  32.47 
 
 		 149 aa  42.7  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  23.53 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  24.24 
 
 		 125 aa  42  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  32.69 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>