81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlg_2389 on replicon NC_008340
Organism: Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  100 
 
 
149 aa  292  1e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  58.51 
 
 
136 aa  93.6  8e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  38.26 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  38.26 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  38.26 
 
 
122 aa  74.7  0.0000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  37.82 
 
 
123 aa  73.6  0.0000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 
122 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 
121 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  43.68 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  45.24 
 
 
129 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  45.88 
 
 
122 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  33.86 
 
 
139 aa  68.2  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  30.91 
 
 
125 aa  67.4  0.00000000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  43.37 
 
 
145 aa  67  0.00000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  43.9 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  44.58 
 
 
134 aa  66.6  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  43.37 
 
 
121 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  42.5 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 
117 aa  65.5  0.0000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 
121 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  41.28 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 
121 aa  64.7  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  35.29 
 
 
111 aa  63.9  0.0000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
125 aa  63.9  0.0000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  30.91 
 
 
125 aa  63.5  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  42.2 
 
 
127 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  29.77 
 
 
159 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  35.77 
 
 
125 aa  62.8  0.000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  36.44 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  39.13 
 
 
122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  40.96 
 
 
128 aa  58.5  0.00000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  36.14 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  39.53 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 
111 aa  56.2  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  35.71 
 
 
127 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  48.65 
 
 
131 aa  55.1  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  32.58 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  50 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 
128 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  36.05 
 
 
125 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  36.05 
 
 
125 aa  52  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  34.71 
 
 
124 aa  52  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  36.05 
 
 
125 aa  52  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  36.05 
 
 
125 aa  52  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  36.05 
 
 
125 aa  52  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  36.21 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  39.29 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  38.55 
 
 
125 aa  50.4  0.000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  35.04 
 
 
132 aa  50.4  0.000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  49.15 
 
 
126 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  39.53 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  34.88 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  40.48 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  37.36 
 
 
149 aa  48.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  32 
 
 
146 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  27.93 
 
 
124 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  34.58 
 
 
135 aa  47.4  0.00007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  35.78 
 
 
119 aa  47  0.00009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  34.09 
 
 
134 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  36.94 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  40.23 
 
 
125 aa  44.7  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  50.94 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0324  general secretion pathway protein I, putative  30.51 
 
 
118 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  32.1 
 
 
126 aa  43.9  0.0007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 
128 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  35.4 
 
 
123 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  35.4 
 
 
123 aa  42.7  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  36.9 
 
 
130 aa  43.1  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3266  MshA pilin protein MshD  27.78 
 
 
144 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  32.47 
 
 
114 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  40.7 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  40.7 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0737  general secretion pathway protein I  32.81 
 
 
138 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4360  hypothetical protein  26.8 
 
 
161 aa  40.4  0.008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.583483 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 
113 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0685  hypothetical protein  27.81 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0668  hypothetical protein  27.81 
 
 
179 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0150  general secretion pathway protein J  37.04 
 
 
241 aa  40  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>