56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0255 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 128 aa  257  4e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 		 124 aa  65.1  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 127 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  35.92 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  36.46 
 
 		 130 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  29.17 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  33.9 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 132 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  28.12 
 
 		 129 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  30.84 
 
 		 122 aa  52.8  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  35 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  33.73 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  48.08 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  31.67 
 
 		 127 aa  52.8  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  33.73 
 
 		 145 aa  51.6  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  33.77 
 
 		 123 aa  51.2  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  32.53 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  29.9 
 
 		 135 aa  51.2  0.000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  38.16 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  33.73 
 
 		 122 aa  50.4  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  33.73 
 
 		 122 aa  50.8  0.000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  34.94 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  34.94 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  34.94 
 
 		 122 aa  50.1  0.00001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 		 159 aa  49.7  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  30.51 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 134 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  31 
 
 		 131 aa  48.9  0.00003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  29.52 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0716  hypothetical protein  39.44 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  32.67 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0681  hypothetical protein  39.44 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  31.65 
 
 		 126 aa  47.8  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0715  hypothetical protein  40.85 
 
 		 208 aa  47.8  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  27.03 
 
 		 134 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  43.4 
 
 		 126 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  26.13 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  32.08 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  39.22 
 
 		 125 aa  46.6  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 139 aa  45.4  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  31.86 
 
 		 121 aa  45.4  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  39.24 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  37.68 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 		 149 aa  43.9  0.0008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  42.11 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  30.3 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  25 
 
 		 124 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  27.71 
 
 		 128 aa  41.2  0.004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  42.86 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>