67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3523 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  100 
 
 
119 aa  237  2.9999999999999997e-62  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  71.93 
 
 
132 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  73.68 
 
 
126 aa  171  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  72.57 
 
 
131 aa  170  6.999999999999999e-42  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  70.54 
 
 
130 aa  165  2e-40  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  69.91 
 
 
130 aa  164  4e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  68.42 
 
 
125 aa  157  5e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  69.16 
 
 
107 aa  152  2e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  61.4 
 
 
124 aa  136  1e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  53.04 
 
 
131 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  54.46 
 
 
113 aa  105  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  44.44 
 
 
134 aa  83.2  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  44.76 
 
 
134 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  43.81 
 
 
135 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  41.9 
 
 
132 aa  76.6  0.00000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  41.9 
 
 
132 aa  76.6  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  43.75 
 
 
136 aa  72.4  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  40.4 
 
 
146 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  43 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  36.27 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  45.36 
 
 
133 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
121 aa  58.2  0.00000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  46.53 
 
 
138 aa  57  0.00000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  47.52 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  45.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  45.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  45.16 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  45.36 
 
 
133 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  35.54 
 
 
127 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  34.31 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  40.86 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  39.78 
 
 
129 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 
145 aa  52.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  42.86 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 
127 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  44.44 
 
 
143 aa  51.6  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  32.46 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  32.46 
 
 
122 aa  51.6  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  40.78 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  32.46 
 
 
122 aa  50.8  0.000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
122 aa  50.4  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
122 aa  50.4  0.000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  39.25 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  31.31 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  39.25 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 
134 aa  48.9  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  39.25 
 
 
136 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  40.82 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  45 
 
 
116 aa  48.9  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  40.82 
 
 
134 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  39.25 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  31.37 
 
 
139 aa  48.5  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  40.82 
 
 
136 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 
128 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  36 
 
 
117 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
127 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  31.07 
 
 
125 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  35.78 
 
 
149 aa  47  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 
122 aa  46.6  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  32.65 
 
 
121 aa  45.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  32.65 
 
 
121 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  35.53 
 
 
121 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4679  Tfp pilus assembly protein major pilin PilA  29.52 
 
 
168 aa  41.2  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>