93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sputcn32_3562 on replicon NC_009438
Organism: Shewanella putrefaciens CN-32



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 122 aa  249  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  94.26 
 
 		 122 aa  240  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  93.44 
 
 		 122 aa  239  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  93.44 
 
 		 122 aa  239  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  94.26 
 
 		 122 aa  238  2e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  93.44 
 
 		 122 aa  236  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  92.62 
 
 		 122 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  92.62 
 
 		 122 aa  235  1e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  92.62 
 
 		 122 aa  211  3.9999999999999995e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  81.51 
 
 		 123 aa  207  5e-53  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  83.76 
 
 		 134 aa  206  7e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  82.2 
 
 		 139 aa  205  2e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  79.49 
 
 		 125 aa  204  5e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  77.97 
 
 		 121 aa  196  1.0000000000000001e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  77.19 
 
 		 145 aa  191  3e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  69.83 
 
 		 121 aa  183  8e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  36.97 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40.57 
 
 		 127 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 		 121 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  34.21 
 
 		 127 aa  89.7  1e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  35.83 
 
 		 121 aa  89.4  1e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  40.68 
 
 		 117 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  40.35 
 
 		 125 aa  88.2  3e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  33.9 
 
 		 131 aa  87.4  6e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  39.18 
 
 		 129 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  39.18 
 
 		 129 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  33.04 
 
 		 128 aa  79.3  0.00000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  34.75 
 
 		 128 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  46.99 
 
 		 121 aa  79  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  32.14 
 
 		 126 aa  73.6  0.0000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  32.08 
 
 		 123 aa  70.1  0.00000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  45.88 
 
 		 149 aa  69.7  0.00000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 		 135 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 136 aa  67  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 		 127 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  37.23 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 		 132 aa  60.8  0.000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  29.7 
 
 		 114 aa  61.2  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 		 132 aa  60.1  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  33.94 
 
 		 135 aa  59.3  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  35.37 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 113 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  29.66 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  29.66 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  30.93 
 
 		 134 aa  58.2  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  31.37 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  27.62 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  33.96 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  27.62 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  33.98 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  33.98 
 
 		 123 aa  53.5  0.0000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  28.28 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  28.85 
 
 		 124 aa  51.2  0.000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  24.56 
 
 		 146 aa  51.2  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  32.53 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  34.95 
 
 		 123 aa  50.1  0.000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 		 144 aa  50.4  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  32.26 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  32.65 
 
 		 130 aa  49.3  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  28.18 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  32.61 
 
 		 131 aa  47.8  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  29.29 
 
 		 132 aa  47  0.00008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  29.82 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 133 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0603  general secretion pathway protein I  25.93 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109646 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  34.69 
 
 		 133 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0590  hypothetical protein  26.17 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  33.67 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 130 aa  42.7  0.002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  24.75 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  29.73 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  29.73 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  29.73 
 
 		 136 aa  41.6  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  30.67 
 
 		 117 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  29.73 
 
 		 134 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  28.83 
 
 		 134 aa  41.2  0.005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  29.73 
 
 		 134 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  26.42 
 
 		 123 aa  40  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>