55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_001887 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 111 aa  223  7e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  91.89 
 
 		 111 aa  208  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  78.18 
 
 		 117 aa  177  4e-44  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  66.67 
 
 		 125 aa  149  2e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 123 aa  82  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  41.07 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 121 aa  80.5  0.000000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  37.72 
 
 		 125 aa  80.1  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 122 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 122 aa  79.3  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  41.18 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 134 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 121 aa  78.6  0.00000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  37.72 
 
 		 131 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 122 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 122 aa  77  0.00000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  38.89 
 
 		 123 aa  75.5  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 		 121 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 		 122 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  35.14 
 
 		 126 aa  74.7  0.0000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  36.61 
 
 		 125 aa  73.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  34.17 
 
 		 128 aa  72.4  0.000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  35.4 
 
 		 127 aa  71.2  0.000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  35.96 
 
 		 159 aa  70.5  0.000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 		 123 aa  69.3  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  41.67 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  41.67 
 
 		 123 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  39.81 
 
 		 127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  40.74 
 
 		 123 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 121 aa  59.3  0.00000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  37.76 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  35.4 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 149 aa  56.2  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  26.55 
 
 		 114 aa  53.5  0.0000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  35.65 
 
 		 143 aa  47  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  32 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  32.65 
 
 		 127 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  28.3 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  27.08 
 
 		 125 aa  44.7  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.91 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  26.92 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2589  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 		 133 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  27.19 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>