50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_03181 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 125 aa  252  1.0000000000000001e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  37.63 
 
 		 129 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  38.71 
 
 		 129 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  30.51 
 
 		 122 aa  60.1  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  30.51 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  30.25 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  29.66 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  36.26 
 
 		 121 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  39.33 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  37.04 
 
 		 128 aa  55.1  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  36.71 
 
 		 121 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 139 aa  53.9  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 121 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 145 aa  53.5  0.0000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  28.43 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 127 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  28.21 
 
 		 134 aa  53.1  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  28.32 
 
 		 123 aa  52.4  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  48.15 
 
 		 128 aa  52.4  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  31.65 
 
 		 125 aa  51.6  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  27.27 
 
 		 131 aa  52  0.000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  36.05 
 
 		 149 aa  52  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  28 
 
 		 125 aa  50.8  0.000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 		 127 aa  49.3  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  30.67 
 
 		 111 aa  48.1  0.00004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  30.4 
 
 		 130 aa  47.8  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  28.18 
 
 		 135 aa  47.4  0.00006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  28.43 
 
 		 127 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  32 
 
 		 111 aa  47  0.00008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  30.85 
 
 		 126 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4372  comG operon protein 3  30.93 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4319  comG operon protein 3  30.93 
 
 		 99 aa  43.5  0.0009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.516067  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  26.73 
 
 		 159 aa  43.1  0.001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  28.97 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  29.91 
 
 		 122 aa  41.6  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  25 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  29.52 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  31.67 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4095  comG operon protein 3  27.84 
 
 		 99 aa  40.4  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.663959  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  29.52 
 
 		 125 aa  40.4  0.008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>