97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4353 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 123 aa  253  6e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  86.44 
 
 		 139 aa  218  1.9999999999999999e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  86.44 
 
 		 122 aa  214  2.9999999999999998e-55  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  85.71 
 
 		 122 aa  214  4e-55  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  85.59 
 
 		 122 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  84.75 
 
 		 122 aa  211  1.9999999999999998e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  84.75 
 
 		 122 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  84.75 
 
 		 122 aa  210  3.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  83.9 
 
 		 122 aa  209  7.999999999999999e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  81.82 
 
 		 134 aa  209  1e-53  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  81.51 
 
 		 122 aa  207  5e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  82.05 
 
 		 125 aa  206  1e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  76.07 
 
 		 145 aa  194  2.0000000000000003e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  79.82 
 
 		 121 aa  194  3e-49  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  68.64 
 
 		 121 aa  182  2.0000000000000003e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  84.35 
 
 		 122 aa  179  9.000000000000001e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  37.29 
 
 		 131 aa  98.2  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  43.86 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  36.28 
 
 		 159 aa  95.9  1e-19  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  38.46 
 
 		 121 aa  95.1  3e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  39.83 
 
 		 117 aa  93.6  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  37.61 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  41.12 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 		 128 aa  89  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 125 aa  88.6  3e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  42.55 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  42.55 
 
 		 129 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 		 111 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 111 aa  79.7  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 128 aa  78.6  0.00000000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  33.64 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  45.57 
 
 		 121 aa  73.6  0.0000000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  37.82 
 
 		 149 aa  73.6  0.0000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  27.97 
 
 		 126 aa  73.2  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 		 135 aa  70.5  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35.29 
 
 		 127 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 		 114 aa  65.5  0.0000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  33.02 
 
 		 132 aa  61.6  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  33.02 
 
 		 132 aa  61.2  0.000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  33.04 
 
 		 125 aa  61.2  0.000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  33.93 
 
 		 113 aa  60.8  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  28.43 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  34.74 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  32.04 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  31.07 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  32.04 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  31.45 
 
 		 124 aa  58.2  0.00000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 		 123 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  34.58 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  34.58 
 
 		 123 aa  57.8  0.00000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 		 146 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  29.17 
 
 		 134 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  34.31 
 
 		 119 aa  55.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  31.68 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  38.78 
 
 		 123 aa  54.3  0.0000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  28.83 
 
 		 124 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  37.63 
 
 		 136 aa  53.9  0.0000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 		 126 aa  53.9  0.0000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.93 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  28.32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  28.32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  28.32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  28.32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  28.32 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 133 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  33.77 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  35.63 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  30.61 
 
 		 130 aa  50.4  0.000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  32.77 
 
 		 133 aa  50.4  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  30.53 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  25.96 
 
 		 124 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  33.98 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  38.38 
 
 		 144 aa  47.4  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  31.62 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  31.62 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  32.48 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  31.62 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  31.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  31.62 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  31.62 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  31.62 
 
 		 136 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  30.33 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  27.66 
 
 		 117 aa  45.4  0.0003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0603  general secretion pathway protein I  27.78 
 
 		 114 aa  43.9  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109646 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  34.12 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0590  hypothetical protein  27.78 
 
 		 114 aa  42  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  29.07 
 
 		 107 aa  41.6  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  26.92 
 
 		 96 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1100  prepilin-type cleavage/methylation  31.71 
 
 		 173 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>