50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1384 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1384  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 144 aa  280  6.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.35215  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  41.07 
 
 		 125 aa  86.7  9e-17  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  38.61 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  38.61 
 
 		 122 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  38.61 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  33.67 
 
 		 127 aa  68.9  0.00000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 		 122 aa  68.6  0.00000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  36.63 
 
 		 122 aa  67.4  0.00000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  36.63 
 
 		 122 aa  67  0.00000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  39.39 
 
 		 127 aa  66.2  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  35.64 
 
 		 122 aa  66.2  0.0000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 		 122 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  38.61 
 
 		 123 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  37.11 
 
 		 121 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 159 aa  62.8  0.000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  32.2 
 
 		 145 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 129 aa  62  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 		 134 aa  62  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 125 aa  61.6  0.000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 		 139 aa  60.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  40.26 
 
 		 129 aa  60.8  0.000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  39.82 
 
 		 136 aa  60.5  0.000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  31 
 
 		 121 aa  57  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  36.9 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  37.21 
 
 		 135 aa  54.7  0.0000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  32.56 
 
 		 117 aa  53.1  0.000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  27 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  35.24 
 
 		 132 aa  49.7  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  32.05 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  32.05 
 
 		 121 aa  48.5  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  34.18 
 
 		 111 aa  47  0.00009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  32.91 
 
 		 111 aa  47  0.0001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  36.63 
 
 		 122 aa  45.8  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  32.11 
 
 		 130 aa  45.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 		 126 aa  46.2  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  32.89 
 
 		 121 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  40.51 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  35.8 
 
 		 130 aa  45.1  0.0003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  33.33 
 
 		 123 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  38.55 
 
 		 131 aa  45.1  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  27.38 
 
 		 126 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  40.98 
 
 		 134 aa  43.5  0.0008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  40.98 
 
 		 134 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  39.74 
 
 		 135 aa  42  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 130 aa  42  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5191  type IV pilus modification protein PilV  33.85 
 
 		 185 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.186729  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  36.78 
 
 		 149 aa  40.4  0.008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  28.28 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  27.38 
 
 		 114 aa  40  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  34.88 
 
 		 125 aa  40  0.01  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>