53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3575 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 124 aa  252  1.0000000000000001e-66  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  32.28 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  32.28 
 
 		 129 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 		 128 aa  65.1  0.0000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  34.65 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  35.45 
 
 		 125 aa  58.9  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  35.45 
 
 		 125 aa  58.5  0.00000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  31.45 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  30 
 
 		 121 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  26.02 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  30.16 
 
 		 127 aa  56.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  28.91 
 
 		 159 aa  56.2  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  31.43 
 
 		 139 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  26.23 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  31.43 
 
 		 145 aa  54.3  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  30.56 
 
 		 125 aa  53.5  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 122 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 122 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 122 aa  52.4  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  28.04 
 
 		 128 aa  52.8  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  33.96 
 
 		 121 aa  52  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  34.55 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  28.85 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  30.25 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  50.4  0.000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  27.42 
 
 		 121 aa  50.4  0.000008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  31.48 
 
 		 121 aa  50.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  27.45 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  28.16 
 
 		 122 aa  49.7  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  29.25 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  27.93 
 
 		 149 aa  48.1  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  28.7 
 
 		 121 aa  48.1  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  28.43 
 
 		 125 aa  47.8  0.00005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  27.93 
 
 		 130 aa  47  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  36.92 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  31.13 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  26.09 
 
 		 113 aa  43.9  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 126 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  38.6 
 
 		 134 aa  42.7  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  38.18 
 
 		 146 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  29.75 
 
 		 135 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  29.2 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0972  hypothetical protein  40.98 
 
 		 147 aa  41.2  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  26.92 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  26.17 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  27.97 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  23.97 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  38.98 
 
 		 149 aa  40  0.01  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>