12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_0972 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010424  Daud_0972  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  287  4e-77  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2704  hypothetical protein  32 
 
 
125 aa  62.4  0.000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1548  N-terminal methylation  39.52 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.14409 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1026  hypothetical protein  36.96 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0995  hypothetical protein  30.65 
 
 
123 aa  47  0.00009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0393  MshA pilin protein MshD  29.2 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000144635  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2562  hypothetical protein  30.88 
 
 
333 aa  45.1  0.0004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0991662  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1051  hypothetical protein  35.85 
 
 
113 aa  43.5  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000854746  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0964  N-terminal methylation  26.4 
 
 
130 aa  42  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  40.98 
 
 
124 aa  41.2  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  43.4 
 
 
116 aa  41.6  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  32.94 
 
 
129 aa  40  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>