38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2204 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 116 aa  229  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  47.89 
 
 		 126 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  44.58 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  39.45 
 
 		 130 aa  55.1  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  49.18 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  43.06 
 
 		 135 aa  53.5  0.000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  45.45 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  39.47 
 
 		 134 aa  52.4  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  41.43 
 
 		 132 aa  52  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  42.86 
 
 		 126 aa  51.6  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  40.91 
 
 		 129 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  41.54 
 
 		 129 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  45 
 
 		 131 aa  50.1  0.00001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  41.43 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 131 aa  48.9  0.00002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  45 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  56.94 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  40.85 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  40.85 
 
 		 132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  42.47 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  50 
 
 		 122 aa  47  0.00008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40.62 
 
 		 127 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 		 128 aa  45.4  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  29.36 
 
 		 145 aa  44.3  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  41.46 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  41.46 
 
 		 125 aa  43.9  0.0008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0488  hypothetical protein  47.27 
 
 		 161 aa  43.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000470807  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  42.11 
 
 		 128 aa  43.1  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  31.63 
 
 		 117 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0972  hypothetical protein  43.4 
 
 		 147 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  29.2 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  32.43 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  43.75 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>