16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2891 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  100 
 
 		 149 aa  296  8e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1118  general secretory pathway protein I  35.66 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1523  putative pseudopilin I precursor  34.03 
 
 		 134 aa  58.9  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.261509  normal  0.295629 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0684  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 135 aa  51.6  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0270036 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02680  general secretion pathway protein I  34.04 
 
 		 138 aa  49.3  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  37.11 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  31.18 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4156  general secretion pathway protein I  28.86 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000753103 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  30.43 
 
 		 127 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0550  type II secretory pathway pseudopilin  41.11 
 
 		 139 aa  42.7  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0591263 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  30.99 
 
 		 126 aa  40.8  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_002936  DET1353  GspI/GspJ family type II secretion system protein  38.18 
 
 		 151 aa  40.8  0.007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0972416  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1510  hypothetical protein  29.46 
 
 		 130 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000935366  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 		 124 aa  40  0.01  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  35.21 
 
 		 136 aa  40  0.01  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>