77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_3180 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 126 aa  244  3e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  56.3 
 
 		 122 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  53.28 
 
 		 124 aa  89  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  41.53 
 
 		 132 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  41.23 
 
 		 134 aa  80.1  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  41.53 
 
 		 132 aa  79.7  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  41.75 
 
 		 134 aa  77.8  0.00000000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  36.75 
 
 		 146 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  37.07 
 
 		 136 aa  73.6  0.0000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  40.71 
 
 		 135 aa  72  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  38.66 
 
 		 135 aa  67  0.00000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  47.89 
 
 		 116 aa  65.9  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  37.61 
 
 		 125 aa  63.9  0.0000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  31.3 
 
 		 131 aa  57.4  0.00000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  31.36 
 
 		 130 aa  53.9  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  32.48 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  32.76 
 
 		 131 aa  51.6  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  28.95 
 
 		 130 aa  51.6  0.000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  29.27 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  33.67 
 
 		 125 aa  50.8  0.000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  49.15 
 
 		 149 aa  50.4  0.000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  29.41 
 
 		 130 aa  50.4  0.000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  37.61 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 		 136 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  37.96 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  27.83 
 
 		 132 aa  50.1  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  37.96 
 
 		 136 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 		 134 aa  49.7  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  37.96 
 
 		 134 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  30.43 
 
 		 126 aa  49.3  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  33.98 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  29 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  30.33 
 
 		 124 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  42.37 
 
 		 129 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  43.4 
 
 		 128 aa  47.4  0.00007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  37.74 
 
 		 133 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  38 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  30.93 
 
 		 134 aa  45.8  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  39.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  39.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  28.71 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  39.58 
 
 		 133 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  32.29 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  46.03 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  30.1 
 
 		 122 aa  44.7  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 		 145 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  33.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  25.41 
 
 		 159 aa  44.7  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  30.33 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  38.46 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  29.92 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0175  general secretion pathway protein J  30.48 
 
 		 259 aa  43.1  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.729564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.5  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  29.13 
 
 		 122 aa  43.1  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  30.21 
 
 		 139 aa  41.6  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  29.7 
 
 		 121 aa  42  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  44.71 
 
 		 138 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  25.64 
 
 		 126 aa  41.6  0.004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  27.12 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  34.72 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 		 138 aa  41.2  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  36.07 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  36.07 
 
 		 121 aa  41.2  0.006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  30.99 
 
 		 149 aa  40.4  0.007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0216  hypothetical protein  35.85 
 
 		 551 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.590946  normal  0.120433 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  25.23 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  29.9 
 
 		 233 aa  40.4  0.009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>