19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0678 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  227  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0590  hypothetical protein  59.26 
 
 		 114 aa  136  1e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0603  general secretion pathway protein I  58.33 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000109646 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  53.64 
 
 		 123 aa  123  9e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.28146 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0324  general secretion pathway protein I, putative  48.21 
 
 		 118 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1276  hypothetical protein  48.62 
 
 		 116 aa  96.7  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0681  hypothetical protein  33.63 
 
 		 208 aa  50.8  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.87391  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0716  hypothetical protein  33.63 
 
 		 208 aa  50.1  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0715  hypothetical protein  33.63 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.659875  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2613  hypothetical protein  28.28 
 
 		 263 aa  44.7  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76594  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1034  hypothetical protein  32.58 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  28 
 
 		 127 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  35.85 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  30.49 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  28 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  29.79 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  42 
 
 		 128 aa  40.4  0.008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  23.97 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.607057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>