58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_00606 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  100 
 
 
111 aa  222  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  91.89 
 
 
111 aa  208  2e-53  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  80.18 
 
 
117 aa  181  3e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  65.77 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 
121 aa  79.7  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  39.29 
 
 
123 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  35.96 
 
 
125 aa  79.3  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  40.18 
 
 
145 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 
131 aa  78.6  0.00000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 
139 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 
121 aa  77.8  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 
122 aa  77  0.00000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  35.14 
 
 
126 aa  76.3  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  38.89 
 
 
123 aa  76.3  0.0000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 
122 aa  76.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  40.2 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
122 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  35.14 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  36.61 
 
 
122 aa  74.3  0.0000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  36.61 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  35.96 
 
 
121 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  36.61 
 
 
122 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  35.71 
 
 
122 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  39.47 
 
 
128 aa  72.4  0.000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  37.72 
 
 
159 aa  71.2  0.000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  34.82 
 
 
125 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 
123 aa  68.6  0.00000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  39.6 
 
 
127 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  41.67 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  41.67 
 
 
123 aa  67.8  0.00000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  33.63 
 
 
127 aa  67.4  0.00000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  36.84 
 
 
121 aa  67.4  0.00000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 
123 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  35.29 
 
 
149 aa  63.9  0.0000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  40.74 
 
 
123 aa  62.4  0.000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  36.28 
 
 
129 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  36.28 
 
 
129 aa  60.1  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  27.03 
 
 
114 aa  58.2  0.00000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  38.39 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  30.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  30.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  30.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.269723 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  30.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  30.67 
 
 
125 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 
127 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  36.78 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2589  general secretion pathway protein I  32.41 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  27.35 
 
 
125 aa  45.1  0.0003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  26.67 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  26.21 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  31.4 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  26.61 
 
 
124 aa  42  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0678  hypothetical protein  29.79 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  28.57 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0324  general secretion pathway protein I, putative  29.46 
 
 
118 aa  41.2  0.006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3369  N-terminal methylation  28.18 
 
 
123 aa  40.4  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.28146 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>