68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ECD_02833 on replicon CP001509
Organism: Escherichia coli BL21(DE3)



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  100 
 
 
123 aa  249  6e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  100 
 
 
123 aa  249  6e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  95.93 
 
 
123 aa  239  1e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  97.56 
 
 
123 aa  220  6e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  96.75 
 
 
123 aa  216  6e-56  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  94.31 
 
 
123 aa  213  5e-55  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  42.34 
 
 
117 aa  91.3  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  46.6 
 
 
121 aa  90.5  6e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  48.11 
 
 
121 aa  89.7  1e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 
111 aa  85.5  2e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  41.96 
 
 
126 aa  85.9  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 
111 aa  84.7  4e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  45.63 
 
 
128 aa  83.6  8e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  39.64 
 
 
125 aa  82.8  0.000000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  40.78 
 
 
127 aa  80.5  0.000000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  45.26 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  46.24 
 
 
129 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  41.75 
 
 
125 aa  78.2  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  37.38 
 
 
145 aa  77.8  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  34.58 
 
 
123 aa  77.4  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  38.46 
 
 
121 aa  76.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  39.09 
 
 
131 aa  76.3  0.0000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
121 aa  75.5  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  35.85 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  44.55 
 
 
128 aa  74.3  0.0000000000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  35.85 
 
 
134 aa  74.3  0.0000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 
122 aa  72.8  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 
122 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 
122 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  40.59 
 
 
127 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  33.98 
 
 
122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  34.58 
 
 
122 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  30.84 
 
 
139 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  39.81 
 
 
159 aa  68.6  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  36.73 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  36.73 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  30.77 
 
 
114 aa  60.5  0.000000008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  30.69 
 
 
125 aa  60.5  0.000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  36.08 
 
 
136 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  36 
 
 
127 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  35.85 
 
 
122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  36.28 
 
 
149 aa  54.7  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  35.9 
 
 
124 aa  53.1  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 
121 aa  52.8  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 
135 aa  48.9  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  42.68 
 
 
143 aa  47.8  0.00006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  33.05 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  37.97 
 
 
131 aa  45.1  0.0004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  33.9 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  32.1 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  35.37 
 
 
136 aa  42.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  29 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  42 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  29 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  52.5 
 
 
246 aa  42.4  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  29 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.269723 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  29 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  29 
 
 
125 aa  42.4  0.002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  30.86 
 
 
130 aa  42  0.003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  27.91 
 
 
96 aa  41.6  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  30.3 
 
 
134 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  31.96 
 
 
132 aa  40.4  0.008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
124 aa  40.4  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  32.94 
 
 
149 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 
126 aa  40.4  0.009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>