78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc3108 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  100 
 
 		 135 aa  271  2.0000000000000002e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  81.68 
 
 		 132 aa  223  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  80.15 
 
 		 132 aa  221  3e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  69.6 
 
 		 134 aa  179  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  68.85 
 
 		 134 aa  171  2.9999999999999996e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  49.22 
 
 		 146 aa  116  9.999999999999999e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  56.1 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  56.1 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  56.1 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  56.1 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  56.1 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  56.1 
 
 		 136 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  56.1 
 
 		 134 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  54.47 
 
 		 134 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  49.64 
 
 		 143 aa  105  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  54.33 
 
 		 145 aa  103  7e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  54.31 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  54.31 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  54.31 
 
 		 133 aa  102  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  51.16 
 
 		 138 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  48.84 
 
 		 138 aa  99  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  51.72 
 
 		 133 aa  97.8  4e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  51.72 
 
 		 133 aa  96.3  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  46.88 
 
 		 117 aa  91.3  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  45.54 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  42.98 
 
 		 135 aa  87.4  7e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  38.84 
 
 		 131 aa  80.5  0.000000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  41.09 
 
 		 132 aa  80.1  0.000000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  43.64 
 
 		 125 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  41.6 
 
 		 131 aa  79  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  43.4 
 
 		 119 aa  79  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  40.52 
 
 		 126 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  42.5 
 
 		 130 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  41.28 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  41.67 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  40.71 
 
 		 126 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  40.71 
 
 		 113 aa  71.2  0.000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  36.54 
 
 		 107 aa  67  0.00000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  48.25 
 
 		 122 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  47.37 
 
 		 124 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  30.39 
 
 		 121 aa  62  0.000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  29.41 
 
 		 134 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  32.04 
 
 		 122 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  29.81 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  37.93 
 
 		 127 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  32.04 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  33.01 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  31.68 
 
 		 123 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  26.67 
 
 		 125 aa  54.7  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  38.61 
 
 		 127 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  31.07 
 
 		 121 aa  54.3  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  43.06 
 
 		 116 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  26.23 
 
 		 127 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  30.17 
 
 		 131 aa  51.2  0.000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  29.9 
 
 		 128 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  30.7 
 
 		 159 aa  50.4  0.000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  28 
 
 		 128 aa  49.3  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  37.39 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  41.27 
 
 		 128 aa  48.1  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  38.1 
 
 		 121 aa  47.4  0.00007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  38.1 
 
 		 121 aa  47  0.00009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  38.89 
 
 		 130 aa  46.6  0.0001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  31.13 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 129 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 129 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  26 
 
 		 125 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  37.88 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  34.26 
 
 		 122 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  37.04 
 
 		 125 aa  41.6  0.004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5692  hypothetical protein  32.26 
 
 		 233 aa  40  0.01  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.434625  normal  0.174572 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>