75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_0056 on replicon NC_010551
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_0056  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 117 aa  237  4e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.216245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0046  general secretion pathway protein I  99.15 
 
 		 133 aa  235  2e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3238  general secretion pathway protein I  94.87 
 
 		 133 aa  202  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.701162 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0056  general secretion pathway protein I  94.02 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.303268  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0014  general secretion pathway protein I  94.02 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.492457  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0075  general secretion pathway protein I  94.02 
 
 		 133 aa  196  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0057  general secretion pathway protein I  86.32 
 
 		 145 aa  181  4.0000000000000006e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0014  general secretion pathway protein I  84.62 
 
 		 136 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0014  general secretion pathway protein I  84.62 
 
 		 136 aa  175  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0635584  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0226  general secretory pathway protein I  84.62 
 
 		 134 aa  175  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.801679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0013  general secretory pathway protein I  82.91 
 
 		 134 aa  174  3e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2668  general secretory pathway protein I  83.76 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.742889  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3512  general secretory pathway protein I  83.76 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1884  general secretory pathway protein I  83.76 
 
 		 136 aa  173  7e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.780964  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2779  general secretory pathway protein I  83.76 
 
 		 134 aa  173  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3076  general secretion pathway protein I  76.92 
 
 		 143 aa  167  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000627252 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3942  general secretion pathway protein I  73.5 
 
 		 138 aa  157  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.168829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4495  general secretion pathway protein I  73.5 
 
 		 138 aa  154  4e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.442933  normal  0.13255 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  51.3 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  51.3 
 
 		 134 aa  114  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  49.14 
 
 		 146 aa  112  1.0000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  50.44 
 
 		 135 aa  112  2.0000000000000002e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  46.9 
 
 		 132 aa  110  7.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  46.9 
 
 		 132 aa  109  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  46.24 
 
 		 136 aa  90.9  5e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  44.14 
 
 		 135 aa  86.3  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  40.2 
 
 		 131 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  41.75 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  45.74 
 
 		 130 aa  73.6  0.0000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3421  general secretion pathway protein I  42.73 
 
 		 113 aa  70.1  0.00000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000443599 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  39.78 
 
 		 131 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  41.94 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5691  type II secretion system protein I/J  39.58 
 
 		 107 aa  68.2  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.297259  normal  0.118469 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  38.71 
 
 		 132 aa  67.4  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1079  general secretion pathway protein I  40 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.637653  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0536  general secretion pathway protein I  39.22 
 
 		 126 aa  65.5  0.0000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  31.82 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  36.56 
 
 		 126 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 		 123 aa  60.8  0.000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 125 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  30.09 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 122 aa  57.4  0.00000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 122 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  27.43 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  31.91 
 
 		 122 aa  56.2  0.0000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4830  HxcV putative pseudopilin  44.64 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.95899  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  30.85 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  36.08 
 
 		 127 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  29.79 
 
 		 125 aa  53.5  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55500  HxcV putative pseudopilin  44.25 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0317922 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  27.43 
 
 		 134 aa  52.8  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  27.27 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  40.3 
 
 		 121 aa  51.2  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  40.3 
 
 		 121 aa  51.6  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  40.68 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2204  general secretion pathway protein I  36.14 
 
 		 116 aa  47.4  0.00006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0202192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  43.14 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  34.04 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  26.79 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  28.44 
 
 		 128 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  24.78 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  27.59 
 
 		 159 aa  42.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  25.89 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  28.12 
 
 		 125 aa  41.2  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  35.09 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  38.98 
 
 		 130 aa  40.4  0.008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  36.11 
 
 		 117 aa  40  0.009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>