63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_3242 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  100 
 
 		 123 aa  249  1e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  93.5 
 
 		 123 aa  235  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  94.31 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  94.31 
 
 		 123 aa  214  2.9999999999999998e-55  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  95.12 
 
 		 123 aa  214  5e-55  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  94.31 
 
 		 123 aa  211  3.9999999999999995e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  46.6 
 
 		 121 aa  89  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  48.11 
 
 		 121 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  42.34 
 
 		 117 aa  87.8  4e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  41.96 
 
 		 126 aa  83.2  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  44.66 
 
 		 128 aa  82.8  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  39.64 
 
 		 125 aa  82.4  0.000000000000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 		 111 aa  80.9  0.000000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 		 111 aa  80.5  0.000000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  40.19 
 
 		 145 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  50 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  50 
 
 		 129 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  39.09 
 
 		 121 aa  77  0.00000000000009  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 		 123 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  38.83 
 
 		 127 aa  75.9  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  39.42 
 
 		 121 aa  75.1  0.0000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  42.16 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  36.79 
 
 		 125 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  36.79 
 
 		 134 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  38.18 
 
 		 131 aa  72  0.000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  35.92 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  35.92 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  35.92 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  36.45 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  36.45 
 
 		 122 aa  71.2  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  44.55 
 
 		 128 aa  71.2  0.000000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  36.45 
 
 		 122 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  47.5 
 
 		 127 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  35.51 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  34.95 
 
 		 122 aa  70.1  0.000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  31.78 
 
 		 139 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  35.71 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  37.04 
 
 		 159 aa  62.4  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  35.71 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  30.69 
 
 		 125 aa  59.7  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  32.69 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  35.05 
 
 		 136 aa  57  0.00000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  37.86 
 
 		 122 aa  53.5  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  38.75 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  40.48 
 
 		 149 aa  53.1  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  35 
 
 		 127 aa  52  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  35.9 
 
 		 124 aa  52.4  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  31.58 
 
 		 135 aa  47.4  0.00007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  43.04 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  39.24 
 
 		 131 aa  46.2  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  33.61 
 
 		 132 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  31.93 
 
 		 132 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  32.99 
 
 		 136 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0320  general secretion pathway protein I  42 
 
 		 125 aa  41.6  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.492193  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2854  general secretion pathway protein J  43.4 
 
 		 216 aa  41.6  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.400784  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1418  general secretion pathway protein J  41.51 
 
 		 216 aa  40.8  0.006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1305  general secretion pathway protein J  54.29 
 
 		 246 aa  40.8  0.006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  42.11 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03181  general secretory pathway component, cryptic  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0383  general secretion pathway protein I  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.269723 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0383  general secretion pathway protein I  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03132  hypothetical protein  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3524  general secretion pathway protein I  29.63 
 
 		 125 aa  40.4  0.009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>