23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_1009 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_0957  general secretion pathway protein I  100 
 
 		 114 aa  194  3e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.794205  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1009  type II secretion system protein I/J  100 
 
 		 96 aa  192  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3265  general secretion pathway protein I  91.14 
 
 		 79 aa  149  1e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000472125  hitchhiker  0.00000000000000289406 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  27.96 
 
 		 125 aa  54.3  0.0000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  28.12 
 
 		 128 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  29.21 
 
 		 126 aa  53.1  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  31.71 
 
 		 127 aa  49.7  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  30.12 
 
 		 121 aa  50.1  0.00001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  28.92 
 
 		 121 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  29.29 
 
 		 139 aa  47.8  0.00006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  29.87 
 
 		 145 aa  47.4  0.00007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  31.17 
 
 		 121 aa  45.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  29.76 
 
 		 131 aa  45.1  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  26.14 
 
 		 117 aa  42  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  29.07 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  29.07 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  27.91 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  27.37 
 
 		 121 aa  41.6  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  27.91 
 
 		 123 aa  41.6  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  26.92 
 
 		 123 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  27.91 
 
 		 123 aa  40.8  0.006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0171  general secretion pathway protein I  29.73 
 
 		 122 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  24.21 
 
 		 122 aa  40  0.01  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0506331 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>