66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_2374 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008789  Hhal_2374  general secretion pathway protein I  100 
 
 
143 aa  281  3.0000000000000004e-75  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.764605  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2389  general secretion pathway protein I  42.5 
 
 
149 aa  86.3  1e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000242378 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2301  general secretion pathway protein I  42.35 
 
 
117 aa  67  0.00000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1896  general secretion pathway protein I  50 
 
 
135 aa  66.2  0.0000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1411  general secretion pathway protein I  38.68 
 
 
127 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0233232  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0233  general secretion pathway protein I  48.04 
 
 
136 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001887  general secretion pathway protein I  35.65 
 
 
111 aa  61.6  0.000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3407  general secretion pathway protein GspI  32.26 
 
 
123 aa  61.2  0.000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.937409  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00606  general secretion pathway protein I  36.78 
 
 
111 aa  60.5  0.000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3311  type II secretion system protein I/J  34.92 
 
 
124 aa  59.3  0.00000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2855  general secretion pathway protein I  33.66 
 
 
121 aa  57.8  0.00000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2921  general secretion pathway protein I  36.56 
 
 
127 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.259382  normal  0.143234 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2534  general secretion pathway protein I  45.12 
 
 
136 aa  57.4  0.00000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0400715  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2919  general secretion pathway protein I  34.57 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24050  general secretion pathway protein I  38.55 
 
 
129 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1417  general secretion pathway protein I  32.67 
 
 
121 aa  55.5  0.0000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.834433  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2034  general secretion pathway protein I  38.55 
 
 
129 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1314  type II secretory pathway protein LspI  30.85 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1353  general secretion pathway protein I  30.95 
 
 
125 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0146  general secretion pathway protein I  37.25 
 
 
130 aa  54.3  0.0000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1311  type II secretory pathway protein LspI  32.53 
 
 
125 aa  54.3  0.0000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4353  general secretion pathway protein I  36.05 
 
 
123 aa  53.5  0.0000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0174  general secretion pathway protein I  37.35 
 
 
121 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.833715  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4246  general secretion pathway protein I  32.98 
 
 
126 aa  53.5  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0680895 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4729  general secretion pathway protein I  34.94 
 
 
139 aa  52.8  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.768046  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3575  general secretion pathway protein I  32.17 
 
 
124 aa  52.4  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.607057 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4586  general secretion pathway protein I  34.09 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.589352  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0255  general secretion pathway protein I  35.59 
 
 
128 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0110  general secretion pathway protein I  35.8 
 
 
145 aa  50.8  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0236  general secretion pathway protein I  35.37 
 
 
131 aa  50.8  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0008  general secretion pathway protein I  31.07 
 
 
121 aa  50.4  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.172677 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1475  general secretion pathway protein I  34.62 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0126  general secretion pathway protein I  35.71 
 
 
121 aa  48.9  0.00002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3614  general secretion pathway protein I  36.59 
 
 
134 aa  48.9  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0652  general secretion pathway protein I  37.36 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0185072  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02783  hypothetical protein  42.17 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000320273  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3393  general secretion pathway protein I  36.36 
 
 
132 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02833  hypothetical type II secretion protein  42.17 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000311781  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3046  general secretion pathway protein I  45.45 
 
 
132 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.934205  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3386  general secretion pathway protein I  47.17 
 
 
134 aa  48.1  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3133  general secretion pathway protein I  42.17 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3422  general secretion pathway protein I  32.52 
 
 
123 aa  48.1  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1063  general secretion pathway protein I  48.21 
 
 
146 aa  47.4  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0619826  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0673  general secretion pathway protein I  37.5 
 
 
130 aa  47  0.00009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0386327  normal  0.248566 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3180  general secretion pathway protein I  42.86 
 
 
126 aa  47  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0631485  normal  0.0212721 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3108  general secretory pathway I transmembrane protein  35.51 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.595144  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3242  general secretion pathway protein GspI  42.5 
 
 
123 aa  45.4  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.754588 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0156  general secretion pathway protein I  32.14 
 
 
122 aa  45.8  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1323  general secretion pathway protein I  43.86 
 
 
130 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0161  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.890337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0156  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
122 aa  45.1  0.0003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0158  general secretion pathway protein I  28.92 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0506331 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4201  general secretion pathway protein I  32.14 
 
 
122 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0158  general secretion pathway protein I  32.14 
 
 
122 aa  44.7  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0154  general secretion pathway protein I  33.33 
 
 
122 aa  44.7  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03961  general secretion pathway protein I  28.26 
 
 
159 aa  44.3  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0923  general secretion pathway protein I  39.24 
 
 
131 aa  44.7  0.0005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.076097  normal  0.842092 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3223  general secretion pathway protein I  47.17 
 
 
134 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1304  general secretion pathway protein I  32.53 
 
 
125 aa  44.3  0.0006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3562  general secretion pathway protein I  32.5 
 
 
122 aa  44.3  0.0006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0102  general secretion pathway protein I  41.51 
 
 
128 aa  43.1  0.001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0149  general secretion pathway protein I  30.38 
 
 
125 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2891  general secretion pathway protein H  41.38 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.293786  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3523  general secretion pathway protein I  45.76 
 
 
119 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0107932  normal  0.636393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3130  general secretion pathway protein I  40.74 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.922976  normal  0.035398 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0762  general secretion pathway protein I  34.44 
 
 
125 aa  40.4  0.008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987746  normal  0.118153 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>