252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2172 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 267 aa  541  1e-153  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  53.78 
 
 		 244 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  55.27 
 
 		 243 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  55.27 
 
 		 243 aa  235  7e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  48.93 
 
 		 250 aa  201  8e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  48.96 
 
 		 219 aa  181  8.000000000000001e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  46.84 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  38.24 
 
 		 268 aa  110  3e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 277 aa  68.2  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 		 266 aa  68.2  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.92 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  33.33 
 
 		 266 aa  65.9  0.0000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  32.47 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  30.95 
 
 		 275 aa  65.5  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  32.18 
 
 		 267 aa  64.7  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.33 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  28.66 
 
 		 268 aa  61.6  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  31.14 
 
 		 262 aa  61.6  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  31.17 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  29.35 
 
 		 268 aa  60.8  0.00000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  30.72 
 
 		 247 aa  60.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.81 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  24.52 
 
 		 265 aa  60.1  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  30.85 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  26.7 
 
 		 271 aa  60.1  0.00000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  28.65 
 
 		 248 aa  60.1  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  30.54 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  30.88 
 
 		 340 aa  59.7  0.00000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  29.83 
 
 		 263 aa  59.7  0.00000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.52 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.09 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  26.79 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  29.19 
 
 		 263 aa  57.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 278 aa  58.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  27.91 
 
 		 281 aa  57.8  0.0000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 316 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  27.23 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  23.53 
 
 		 265 aa  57.4  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  30.12 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2482  peptidase M48, Ste24p  35.03 
 
 		 488 aa  56.6  0.0000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  26.7 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  33.53 
 
 		 474 aa  56.2  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 		 487 aa  56.2  0.0000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  25.65 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  31.89 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.46 
 
 		 269 aa  55.1  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  30.05 
 
 		 494 aa  55.1  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4041  peptidase M48, Ste24p  35.21 
 
 		 548 aa  55.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4033  peptidase M48, Ste24p  28.3 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  29.31 
 
 		 264 aa  54.3  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  31.29 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 		 521 aa  54.3  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  30.2 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  27.72 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  34.96 
 
 		 331 aa  54.3  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0860  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 		 541 aa  54.7  0.000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.283962 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4676  peptidase M48, Ste24p  30.22 
 
 		 554 aa  53.5  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.99 
 
 		 294 aa  53.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.46 
 
 		 269 aa  53.9  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  28.57 
 
 		 314 aa  53.1  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2869  hypothetical protein  34.06 
 
 		 489 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3383  peptidase M48 Ste24p  27.92 
 
 		 521 aa  53.5  0.000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 		 270 aa  53.5  0.000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  30.6 
 
 		 271 aa  53.1  0.000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.3 
 
 		 282 aa  52.8  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  31.82 
 
 		 262 aa  52.8  0.000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4669  peptidase M48, Ste24p  32.04 
 
 		 514 aa  52.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  23.18 
 
 		 275 aa  52.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0926  peptidase M48, Ste24p  26.97 
 
 		 481 aa  52.8  0.000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.240705 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 		 524 aa  52  0.000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  27.33 
 
 		 280 aa  52.4  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  27.67 
 
 		 314 aa  52  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  32.28 
 
 		 493 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  30 
 
 		 573 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  29.7 
 
 		 494 aa  52  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  27.37 
 
 		 314 aa  51.6  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3919  peptidase M48, Ste24p  32.74 
 
 		 549 aa  51.6  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.749041  hitchhiker  0.000945115 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0060  putative signal peptide protein  33.14 
 
 		 533 aa  51.6  0.00001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0678938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  30.81 
 
 		 605 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2419  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 489 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.339461  hitchhiker  0.00116652 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1850  peptidase M48, Ste24p  28.19 
 
 		 278 aa  51.6  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1649  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 489 aa  51.6  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1695  peptidase M48, Ste24p  34.06 
 
 		 485 aa  51.2  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.48 
 
 		 270 aa  50.8  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2169  peptidase M48 Ste24p  30.26 
 
 		 486 aa  50.8  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.139537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1841  peptidase M48, Ste24p  30.72 
 
 		 485 aa  51.2  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.891186  normal  0.107833 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  26.06 
 
 		 274 aa  51.2  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4160  peptidase M48 Ste24p  26.53 
 
 		 489 aa  50.8  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0504491  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  27.07 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.8 
 
 		 269 aa  51.2  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  25.42 
 
 		 273 aa  50.8  0.00002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 279 aa  51.2  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2347  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 489 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.300143  decreased coverage  0.00000000108832 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  24.7 
 
 		 291 aa  50.1  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>