288 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_0698 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 219 aa  451  1.0000000000000001e-126  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  47.7 
 
 		 244 aa  197  7.999999999999999e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  46.86 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  46.86 
 
 		 243 aa  196  3e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  50.52 
 
 		 250 aa  184  6e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  48.96 
 
 		 267 aa  182  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  43.42 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  31.98 
 
 		 268 aa  97.4  2e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 		 291 aa  78.6  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 		 311 aa  77.4  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 		 305 aa  73.9  0.000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  29.41 
 
 		 280 aa  71.6  0.000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  29.65 
 
 		 275 aa  71.6  0.000000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  35.14 
 
 		 265 aa  70.9  0.00000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  26.87 
 
 		 267 aa  70.9  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  30.06 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  30.16 
 
 		 520 aa  69.3  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  28.43 
 
 		 281 aa  68.2  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  29.89 
 
 		 302 aa  68.2  0.00000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.28 
 
 		 289 aa  65.1  0.0000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 		 288 aa  65.5  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  28.71 
 
 		 316 aa  64.7  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  29.5 
 
 		 274 aa  64.3  0.000000001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  25.86 
 
 		 280 aa  64.3  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  31.08 
 
 		 277 aa  64.7  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.32 
 
 		 270 aa  63.5  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  28.37 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  30.16 
 
 		 289 aa  64.3  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  28.37 
 
 		 270 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  27.54 
 
 		 284 aa  62.8  0.000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  26.35 
 
 		 262 aa  61.6  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  29.82 
 
 		 319 aa  61.2  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.84 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.03 
 
 		 279 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 		 282 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  28.67 
 
 		 265 aa  60.8  0.00000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3470  peptidase M48 Ste24p  35.56 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  23.21 
 
 		 262 aa  60.5  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  29.85 
 
 		 271 aa  60.5  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  27 
 
 		 280 aa  60.8  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  25.4 
 
 		 254 aa  59.7  0.00000003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  27.49 
 
 		 267 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 		 314 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  30.2 
 
 		 248 aa  59.3  0.00000004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  28.77 
 
 		 497 aa  58.9  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  29.08 
 
 		 272 aa  58.9  0.00000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  28.25 
 
 		 314 aa  58.9  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  31.51 
 
 		 273 aa  58.5  0.00000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0829  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  31.43 
 
 		 264 aa  58.5  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  29.2 
 
 		 268 aa  58.5  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1212  peptidase M48  32.26 
 
 		 285 aa  58.5  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 		 259 aa  58.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  28.73 
 
 		 314 aa  58.2  0.00000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  28.89 
 
 		 278 aa  58.2  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2567  peptidase M48, Ste24p  31.25 
 
 		 392 aa  58.2  0.00000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1100  peptidase M48, Ste24p  31.03 
 
 		 244 aa  57.8  0.0000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.74 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  27.01 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  31.51 
 
 		 273 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01850  mitochondrial inner membrane metallopeptidase Oma1, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09730)  27.89 
 
 		 376 aa  57.4  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  27.4 
 
 		 505 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  31.21 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  31.79 
 
 		 293 aa  57.4  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  35.71 
 
 		 267 aa  57  0.0000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 		 503 aa  57.4  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  28.95 
 
 		 480 aa  57.4  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  28.97 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  34.11 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  28.67 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 		 496 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  27.89 
 
 		 497 aa  56.2  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  29.33 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  28.48 
 
 		 503 aa  55.8  0.0000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  29.84 
 
 		 278 aa  55.5  0.0000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 		 266 aa  55.5  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  28.57 
 
 		 279 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 478 aa  55.1  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  28.28 
 
 		 271 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1887  peptidase M48, Ste24p  29.87 
 
 		 315 aa  55.1  0.0000008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  26.97 
 
 		 269 aa  55.1  0.0000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  27.08 
 
 		 272 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  25 
 
 		 270 aa  54.3  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 487 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  26.23 
 
 		 270 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  31.1 
 
 		 500 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  27.65 
 
 		 273 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  29.14 
 
 		 476 aa  54.3  0.000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  29.45 
 
 		 432 aa  53.9  0.000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 		 269 aa  53.5  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  27.11 
 
 		 258 aa  53.1  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  29.67 
 
 		 275 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  27.46 
 
 		 269 aa  53.1  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>