297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1589 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 244 aa  485  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  89.71 
 
 		 243 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  89.71 
 
 		 243 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  53.78 
 
 		 267 aa  234  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  55.22 
 
 		 250 aa  232  3e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  47.7 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  45.89 
 
 		 232 aa  175  6e-43  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  35.56 
 
 		 268 aa  124  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  33.85 
 
 		 529 aa  75.9  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  26.69 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 		 266 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  27.84 
 
 		 268 aa  66.2  0.0000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  27.64 
 
 		 505 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  29.56 
 
 		 432 aa  65.9  0.0000000007  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  29.74 
 
 		 247 aa  65.5  0.0000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  26.4 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  30.33 
 
 		 264 aa  64.7  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  32.56 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.94 
 
 		 488 aa  63.2  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  32.87 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  37.3 
 
 		 275 aa  63.2  0.000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  28.79 
 
 		 493 aa  63.5  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  27.38 
 
 		 268 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  34.04 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 		 497 aa  62.4  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  34.21 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  30.33 
 
 		 289 aa  62.4  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  31.61 
 
 		 331 aa  62.4  0.000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  32.89 
 
 		 480 aa  62  0.000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  30.88 
 
 		 497 aa  62  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  32.24 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  32.24 
 
 		 493 aa  61.2  0.00000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2231  peptidase M48 Ste24p  27.04 
 
 		 520 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0336086 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  29.49 
 
 		 524 aa  61.2  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  33.09 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  30.77 
 
 		 561 aa  60.1  0.00000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 		 316 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  32.84 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  29.71 
 
 		 503 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  34.44 
 
 		 259 aa  60.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3110  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 503 aa  60.5  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 		 427 aa  60.1  0.00000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  29.44 
 
 		 231 aa  59.7  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 478 aa  60.1  0.00000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 513 aa  59.7  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  30.54 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  32.35 
 
 		 564 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4141  peptidase M48 Ste24p  32.89 
 
 		 482 aa  58.9  0.00000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0703431  normal  0.108462 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 		 293 aa  58.9  0.00000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 		 275 aa  58.9  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 487 aa  59.3  0.00000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.79 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 500 aa  58.9  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  32.35 
 
 		 564 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 496 aa  58.5  0.00000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.5  0.00000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4269  hypothetical protein  30.92 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  31.76 
 
 		 564 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 497 aa  58.2  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  33.87 
 
 		 284 aa  58.5  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 588 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  32.94 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.5  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  31.76 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  32.75 
 
 		 589 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  27.41 
 
 		 285 aa  57.4  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  32.56 
 
 		 589 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  32.75 
 
 		 560 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  32.56 
 
 		 589 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  32.56 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  32.56 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0680  hypothetical protein  34.71 
 
 		 590 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.201087 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  32.56 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  31.21 
 
 		 553 aa  56.6  0.0000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  32.56 
 
 		 572 aa  57  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 		 494 aa  56.6  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 266 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  33.6 
 
 		 314 aa  56.6  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  32.24 
 
 		 270 aa  56.6  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  26.53 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3286  peptidase M48 Ste24p  34.71 
 
 		 569 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  35.4 
 
 		 480 aa  56.6  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 		 521 aa  56.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2483  peptidase M48, Ste24p  31.33 
 
 		 500 aa  56.2  0.0000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  27.54 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  29.93 
 
 		 269 aa  55.8  0.0000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 		 442 aa  55.8  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  31.97 
 
 		 281 aa  55.8  0.0000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>