More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dshi_2623 on replicon NC_009952
Organism: Dinoroseobacter shibae DFL 12



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  100 
 
 		 250 aa  495  1e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  54.29 
 
 		 244 aa  236  2e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  56.03 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  56.03 
 
 		 243 aa  231  9e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  49.15 
 
 		 267 aa  196  3e-49  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  50.52 
 
 		 219 aa  185  5e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  47.95 
 
 		 232 aa  171  1e-41  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  33.98 
 
 		 268 aa  102  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  27.59 
 
 		 275 aa  71.2  0.00000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  29.85 
 
 		 267 aa  69.7  0.00000000004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  26 
 
 		 271 aa  68.9  0.00000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  27.48 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 		 268 aa  67.8  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  32.93 
 
 		 265 aa  65.9  0.0000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  32.28 
 
 		 331 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  36.23 
 
 		 266 aa  64.7  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  24.42 
 
 		 269 aa  65.1  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  36.6 
 
 		 529 aa  64.7  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  31.62 
 
 		 248 aa  63.9  0.000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  32.93 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 269 aa  63.5  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  34.33 
 
 		 267 aa  63.9  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  32.53 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  29.81 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  30.05 
 
 		 271 aa  62.8  0.000000005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  32.92 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  26.57 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  34.75 
 
 		 231 aa  61.2  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4877  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 492 aa  61.6  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 266 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02141  peptidase M48, Ste24p  35.11 
 
 		 487 aa  61.6  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.522189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  26.2 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1307  hypothetical protein  31.48 
 
 		 490 aa  61.6  0.00000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.31128  normal  0.470451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  26.69 
 
 		 268 aa  61.2  0.00000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3517  peptidase M48 Ste24p  31.37 
 
 		 487 aa  60.5  0.00000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000725556  normal  0.963067 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.78 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.74 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  28.99 
 
 		 289 aa  60.1  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.65 
 
 		 432 aa  60.1  0.00000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  27.89 
 
 		 488 aa  60.5  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  26.44 
 
 		 316 aa  60.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3182  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 487 aa  59.7  0.00000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.258553  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3716  peptidase, M48 family  30.73 
 
 		 487 aa  60.1  0.00000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.997857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  26.37 
 
 		 281 aa  59.7  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  32 
 
 		 284 aa  60.1  0.00000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  34.5 
 
 		 474 aa  60.1  0.00000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  26.58 
 
 		 274 aa  59.3  0.00000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  25.14 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  31.54 
 
 		 265 aa  59.3  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2749  peptidase M48 Ste24p  32.47 
 
 		 494 aa  59.3  0.00000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.114888  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  36.84 
 
 		 427 aa  59.3  0.00000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  28.81 
 
 		 280 aa  58.9  0.00000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1134  peptidase M48 Ste24p  30.73 
 
 		 487 aa  58.9  0.00000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 277 aa  58.9  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  27.23 
 
 		 274 aa  58.9  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 282 aa  58.9  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  28.44 
 
 		 275 aa  58.5  0.00000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0209  peptidase M48, Ste24p  32.77 
 
 		 289 aa  58.5  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  28.26 
 
 		 279 aa  58.5  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  30.77 
 
 		 270 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  28.84 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  26.7 
 
 		 268 aa  58.2  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02386  predicted peptidase  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0985911  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1175  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.108568  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2862  TPR repeat-containing protein YfgC  30.73 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.91 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1182  peptidase M48 Ste24p  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0564416 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2641  TPR repeat-containing protein YfgC  30.73 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00482944  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2628  M48 family peptidase  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0628  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.173678 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02348  hypothetical protein  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.14863  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2641  M48 family peptidase  30.17 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.938933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  28.86 
 
 		 272 aa  57.8  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2868  peptidase, M48 family  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  26.95 
 
 		 269 aa  57.4  0.0000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2731  TPR repeat-containing protein YfgC  30.73 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.211116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2776  M48 family peptidase  30.17 
 
 		 487 aa  57.4  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00342563  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2689  TPR repeat-containing protein YfgC  30.73 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.534359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2753  TPR repeat-containing protein YfgC  30.73 
 
 		 487 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  32.47 
 
 		 269 aa  57.8  0.0000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 		 314 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  29.88 
 
 		 267 aa  57  0.0000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  29.85 
 
 		 247 aa  57  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  34.55 
 
 		 284 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.54 
 
 		 266 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3623  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  30.97 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.619094  normal  0.846236 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 		 269 aa  56.6  0.0000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  28.09 
 
 		 275 aa  56.6  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  27.4 
 
 		 273 aa  56.6  0.0000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  31.52 
 
 		 314 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3812  peptidase M48 Ste24p  31.54 
 
 		 513 aa  56.2  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.685027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  27.5 
 
 		 404 aa  56.2  0.0000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  29.35 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2828  peptidase M48 Ste24p  28.57 
 
 		 284 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  30 
 
 		 319 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0982  TPR repeat-containing Zn-dependent protease  29.5 
 
 		 312 aa  55.5  0.0000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.165427  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  26.63 
 
 		 288 aa  55.8  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3127  M48 family peptidase  31.37 
 
 		 494 aa  55.8  0.0000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000135694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>