More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_2336 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2336  hypothetical protein  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.352855  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1012  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 		 243 aa  488  1e-137  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1589  peptidase M48, Ste24p  89.71 
 
 		 244 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2172  peptidase M48, Ste24p  54.43 
 
 		 267 aa  230  1e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.441617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2623  peptidase M48  55.65 
 
 		 250 aa  227  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0128988 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0698  peptidase M48, Ste24p  46.86 
 
 		 219 aa  196  3e-49  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.228611  normal  0.0160033 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1013  peptidase M48, Ste24p  47.35 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.389833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0591  peptidase M48, Ste24p  39.5 
 
 		 268 aa  133  3e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0662871  normal  0.0131631 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0402  peptidase M48, Ste24p  32.23 
 
 		 529 aa  75.9  0.0000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0120  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0733637 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0123  peptidase M48 Ste24p  29.41 
 
 		 279 aa  69.7  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  28.19 
 
 		 275 aa  67.8  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0821  peptidase M48, Ste24p  30.73 
 
 		 432 aa  68.2  0.0000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.371859  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0856  peptidase M48 Ste24p  27.6 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0990  peptidase M48 Ste24p  28.29 
 
 		 247 aa  65.9  0.0000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.218091  normal  0.424626 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  31.65 
 
 		 248 aa  65.9  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  28.85 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  34.04 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0488  peptidase M48 Ste24p  31.16 
 
 		 505 aa  65.1  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.54801  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  25.7 
 
 		 262 aa  64.3  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0867  peptidase M48, Ste24p  36.67 
 
 		 427 aa  63.9  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.88 
 
 		 266 aa  63.5  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  33.77 
 
 		 259 aa  62  0.000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3390  peptidase M48 Ste24p  26.42 
 
 		 268 aa  62  0.000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.0000000240796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2220  peptidase M48 Ste24p  30.37 
 
 		 474 aa  62.4  0.000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.687721  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4490  peptidase M48 Ste24p  33.56 
 
 		 494 aa  62  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0209  hypothetical protein  32.47 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702463 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1238  peptidase M48, Ste24p  33.08 
 
 		 278 aa  61.6  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0665176  normal  0.164191 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  32 
 
 		 289 aa  61.6  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0277  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 		 497 aa  61.2  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.123523 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  31.11 
 
 		 231 aa  60.5  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1139  peptidase M48 Ste24p  31.58 
 
 		 476 aa  60.5  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  31.97 
 
 		 316 aa  60.8  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0246  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 		 442 aa  60.8  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5285  peptidase M48 Ste24p  34.46 
 
 		 524 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.227088 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  61.2  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4358  peptidase M48 Ste24p  29.94 
 
 		 282 aa  60.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  60.1  0.00000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  32.67 
 
 		 270 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0605  peptidase M48, Ste24p  28.29 
 
 		 494 aa  59.7  0.00000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0552  peptidase M48, Ste24p  30.15 
 
 		 497 aa  59.7  0.00000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125277  normal  0.0387817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5912  peptidase M48 Ste24p  33.78 
 
 		 493 aa  59.7  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0135228  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3503  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 478 aa  59.3  0.00000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.239909 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1823  peptidase M48, Ste24p  34.87 
 
 		 562 aa  59.3  0.00000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2684  peptidase M48, Ste24p  34.72 
 
 		 564 aa  59.3  0.00000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.678599  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7542  hypothetical protein  30.26 
 
 		 488 aa  58.9  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0550  peptidase M48, Ste24p  29.71 
 
 		 503 aa  58.9  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  30.82 
 
 		 266 aa  58.9  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.79 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  28.69 
 
 		 271 aa  58.5  0.00000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2557  peptidase M48 Ste24p  34.72 
 
 		 564 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0229  peptidase M48, Ste24p  31.82 
 
 		 553 aa  58.5  0.00000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.00038191  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2637  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1761  peptidase, putative  31.58 
 
 		 493 aa  58.2  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0448124  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  29.79 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0661  peptidase M48 Ste24p  34.03 
 
 		 593 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3303  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 487 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.433705 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  31.72 
 
 		 267 aa  58.2  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1699  putative peptidase  31.58 
 
 		 475 aa  58.2  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00848357  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0654  M48 family peptidase  33.79 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  29.89 
 
 		 271 aa  58.5  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  35.2 
 
 		 314 aa  58.2  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  33.87 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2026  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 		 588 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.339174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3262  peptidase M48, Ste24p  31.58 
 
 		 480 aa  57.8  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.742551  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3626  peptidase M48 Ste24p  33.11 
 
 		 500 aa  58.5  0.0000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.679206  normal  0.283809 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0825  peptidase M48 Ste24p  30.99 
 
 		 566 aa  58.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2666  peptidase M48 Ste24p  34.03 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  30.66 
 
 		 269 aa  58.2  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0582  hypothetical protein  33.79 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0028  hypothetical protein  33.79 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.189438  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0287  hypothetical protein  33.79 
 
 		 560 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2792  peptidase M48 Ste24p  30.22 
 
 		 479 aa  57.4  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0824  hypothetical protein  33.79 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1538  peptidase M48 Ste24p  34.64 
 
 		 565 aa  57.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0541  peptidase M48, Ste24p:tetratricopeptide TPR_4  33.12 
 
 		 573 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.864475  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0827  hypothetical protein  33.79 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0452  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 496 aa  57.4  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.498871 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0985  M48 family peptidase  33.79 
 
 		 589 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399945  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5968  peptidase M48, Ste24p  34.03 
 
 		 588 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.155936 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 		 272 aa  57  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2415  hypothetical protein  33.79 
 
 		 572 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1437  M48 family peptidase  33.57 
 
 		 264 aa  57  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.142211  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  29.1 
 
 		 275 aa  57  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0617  peptidase M48, Ste24p  28.76 
 
 		 479 aa  57  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0368474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3305  peptidase M48, Ste24p  33.97 
 
 		 278 aa  57  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.137005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5176  peptidase M48 Ste24p  32.64 
 
 		 521 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0508  peptidase M48, Ste24p  28.99 
 
 		 497 aa  56.6  0.0000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0673613  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  35.48 
 
 		 288 aa  57  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2075  peptidase M48 Ste24p  29.24 
 
 		 554 aa  56.6  0.0000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1179  hypothetical protein  31.97 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1185  hypothetical protein  31.97 
 
 		 478 aa  56.6  0.0000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_40690  predicted protein  30.68 
 
 		 331 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  32.12 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0487  peptidase M48, Ste24p  32.39 
 
 		 605 aa  56.6  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.72194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>