More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0153 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
280 aa  568  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  81.36 
 
 
280 aa  456  1e-127  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  69.89 
 
 
311 aa  399  9.999999999999999e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  69.78 
 
 
291 aa  394  1e-109  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  69.14 
 
 
305 aa  379  1e-104  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  67.86 
 
 
284 aa  378  1e-104  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  71.31 
 
 
288 aa  362  5.0000000000000005e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  62.63 
 
 
302 aa  352  5e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  63.9 
 
 
316 aa  297  1e-79  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  56.7 
 
 
319 aa  296  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  60.32 
 
 
340 aa  294  1e-78  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  63.79 
 
 
281 aa  293  2e-78  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 
314 aa  243  3e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  48.52 
 
 
284 aa  243  3e-63  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  47.37 
 
 
314 aa  242  3.9999999999999997e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  50.2 
 
 
273 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  49.58 
 
 
314 aa  241  1e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  49.01 
 
 
273 aa  240  2e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  47.64 
 
 
274 aa  232  5e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  48.29 
 
 
289 aa  227  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  46.88 
 
 
272 aa  225  7e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  50.64 
 
 
270 aa  224  1e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  50.4 
 
 
273 aa  224  1e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  45.7 
 
 
282 aa  219  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  49.36 
 
 
270 aa  220  3e-56  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  49.79 
 
 
271 aa  217  1e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  44.53 
 
 
272 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  49.13 
 
 
267 aa  212  4.9999999999999996e-54  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  38.61 
 
 
349 aa  207  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  43.87 
 
 
271 aa  207  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  43.08 
 
 
272 aa  205  6e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  41.95 
 
 
273 aa  205  6e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  43.08 
 
 
279 aa  205  8e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  38.62 
 
 
404 aa  203  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  42.29 
 
 
272 aa  202  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  37.84 
 
 
344 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  45.06 
 
 
272 aa  199  3.9999999999999996e-50  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  37.84 
 
 
344 aa  199  6e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  37.89 
 
 
353 aa  196  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  38.06 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  38.06 
 
 
350 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  38.28 
 
 
422 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  37.65 
 
 
350 aa  193  3e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  38.72 
 
 
266 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  44.87 
 
 
258 aa  189  2.9999999999999997e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  41.88 
 
 
267 aa  190  2.9999999999999997e-47  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  38.2 
 
 
268 aa  185  7e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  40.17 
 
 
270 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  45.45 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  36.48 
 
 
351 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  36.48 
 
 
350 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  36.48 
 
 
350 aa  182  6e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  36.07 
 
 
346 aa  181  9.000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  36.07 
 
 
344 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  36.07 
 
 
347 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  36.07 
 
 
316 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  36.07 
 
 
347 aa  178  7e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  42.24 
 
 
268 aa  175  8e-43  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  36.67 
 
 
254 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  40.68 
 
 
275 aa  161  1e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  38.26 
 
 
285 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  36.44 
 
 
268 aa  152  5e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  36.6 
 
 
275 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  35.1 
 
 
269 aa  149  6e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  42.18 
 
 
268 aa  149  6e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  34.77 
 
 
267 aa  143  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  43.09 
 
 
248 aa  142  5e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  34.69 
 
 
269 aa  142  7e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  36.36 
 
 
265 aa  140  3e-32  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0370  peptidase M48 Ste24p  33.73 
 
 
271 aa  139  3.9999999999999997e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000609738  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  41.08 
 
 
268 aa  139  3.9999999999999997e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  43.89 
 
 
272 aa  139  6e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  35.15 
 
 
265 aa  137  2e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  38.86 
 
 
262 aa  137  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  36.54 
 
 
320 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  41.34 
 
 
262 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  43.18 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  40.46 
 
 
266 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  41.71 
 
 
274 aa  135  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  39.91 
 
 
264 aa  133  3e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
269 aa  133  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
269 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  40 
 
 
269 aa  133  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  34.43 
 
 
271 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  33.2 
 
 
275 aa  131  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  33.75 
 
 
273 aa  131  1.0000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  38.38 
 
 
265 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  40.91 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  39.13 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  38.86 
 
 
259 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  41.24 
 
 
298 aa  129  4.0000000000000003e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  34.33 
 
 
277 aa  129  7.000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  38.42 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  38.2 
 
 
255 aa  127  3e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  38.46 
 
 
293 aa  125  6e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0107  putative lipoprotein  38.33 
 
 
262 aa  125  6e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  41.86 
 
 
284 aa  125  9e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 
269 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 
269 aa  124  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  36.87 
 
 
266 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>