More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_3118 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  99.14 
 
 
350 aa  693    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  100 
 
 
350 aa  700    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  99.14 
 
 
350 aa  693    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  91.1 
 
 
344 aa  543  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  83 
 
 
353 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  90.07 
 
 
344 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  79.43 
 
 
349 aa  527  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  68.24 
 
 
346 aa  346  4e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  67.98 
 
 
350 aa  343  2e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  68.4 
 
 
351 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  63.01 
 
 
347 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  63.01 
 
 
347 aa  342  4e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  63.01 
 
 
344 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  68.4 
 
 
350 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  63.45 
 
 
316 aa  341  9e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  57.34 
 
 
404 aa  338  8e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  57.76 
 
 
422 aa  335  9e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  58.49 
 
 
266 aa  328  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  42.45 
 
 
319 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  37.89 
 
 
291 aa  203  4e-51  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  41.8 
 
 
284 aa  202  6e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  37.86 
 
 
311 aa  201  9.999999999999999e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  37.28 
 
 
305 aa  199  5e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  40.5 
 
 
284 aa  199  7e-50  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  40.73 
 
 
302 aa  198  9e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  42.04 
 
 
314 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  38.43 
 
 
280 aa  196  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  36.44 
 
 
340 aa  194  2e-48  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  37.6 
 
 
288 aa  190  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
314 aa  186  4e-46  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  38.93 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  39.92 
 
 
281 aa  184  3e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  37.65 
 
 
280 aa  182  6e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.48 
 
 
274 aa  167  2e-40  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  36.63 
 
 
316 aa  166  6.9999999999999995e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  34.91 
 
 
273 aa  155  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  34.91 
 
 
273 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  35.04 
 
 
289 aa  151  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  36.91 
 
 
270 aa  151  1e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  36.6 
 
 
272 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  35.74 
 
 
271 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  36.05 
 
 
270 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
267 aa  145  7.0000000000000006e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  34.58 
 
 
268 aa  146  7.0000000000000006e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  34.05 
 
 
272 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  34.05 
 
 
279 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 
282 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  31.62 
 
 
273 aa  141  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  32.76 
 
 
271 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 
280 aa  139  6e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  33.18 
 
 
270 aa  136  6.0000000000000005e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  32.63 
 
 
273 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  33.77 
 
 
267 aa  135  9e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  32.33 
 
 
272 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  30.8 
 
 
254 aa  123  5e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  33.77 
 
 
268 aa  119  7e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  32.2 
 
 
275 aa  112  8.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  32.47 
 
 
258 aa  109  8.000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  29.55 
 
 
275 aa  106  7e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  28.1 
 
 
268 aa  106  7e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  29.31 
 
 
285 aa  105  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  39.59 
 
 
231 aa  103  4e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  30.08 
 
 
277 aa  103  4e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  33.14 
 
 
270 aa  98.6  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  28.03 
 
 
267 aa  98.2  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  30.6 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
265 aa  97.1  4e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.61 
 
 
266 aa  96.7  6e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  27.85 
 
 
293 aa  95.1  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  35.36 
 
 
262 aa  93.6  5e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  28.5 
 
 
275 aa  93.2  5e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
271 aa  93.6  5e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  31.41 
 
 
268 aa  92.8  9e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  31.56 
 
 
272 aa  92  1e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  35.05 
 
 
264 aa  90.5  4e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  33.33 
 
 
262 aa  90.1  5e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  29.05 
 
 
255 aa  90.1  5e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.02 
 
 
266 aa  89.7  6e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  31.2 
 
 
320 aa  90.1  6e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  31.38 
 
 
268 aa  89.4  8e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  28.57 
 
 
266 aa  88.2  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  33.92 
 
 
248 aa  87.8  3e-16  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  28.33 
 
 
271 aa  86.7  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  29.51 
 
 
259 aa  86.7  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  28.33 
 
 
268 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  25.91 
 
 
273 aa  85.5  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  29.17 
 
 
269 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  30.73 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  33.91 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
284 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  32.07 
 
 
263 aa  85.1  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  24.02 
 
 
269 aa  83.6  0.000000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  27.66 
 
 
266 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  33.33 
 
 
265 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2301  peptidase M48 Ste24p  31.67 
 
 
270 aa  80.1  0.00000000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.114592  normal  0.277953 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  29.39 
 
 
268 aa  80.1  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>