More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0093 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  100 
 
 
340 aa  695    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  60.95 
 
 
305 aa  327  2.0000000000000001e-88  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  60.37 
 
 
311 aa  324  1e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  60.29 
 
 
291 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  64.98 
 
 
316 aa  317  2e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  60.64 
 
 
284 aa  313  2.9999999999999996e-84  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  59.22 
 
 
280 aa  308  1.0000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  61.85 
 
 
288 aa  305  9.000000000000001e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  57.7 
 
 
281 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  51.29 
 
 
319 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  58.3 
 
 
302 aa  290  3e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  59.11 
 
 
280 aa  275  1.0000000000000001e-72  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  47.04 
 
 
284 aa  258  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  49.62 
 
 
274 aa  251  1e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  42.27 
 
 
314 aa  239  4e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  45.35 
 
 
314 aa  237  2e-61  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  49.79 
 
 
289 aa  236  4e-61  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  44.57 
 
 
314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  50 
 
 
271 aa  233  3e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  48.64 
 
 
273 aa  230  2e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  47.47 
 
 
273 aa  225  8e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  46.74 
 
 
273 aa  220  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  47.18 
 
 
272 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  48.16 
 
 
273 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  43.49 
 
 
282 aa  211  1e-53  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  44.37 
 
 
272 aa  210  2e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  44.49 
 
 
267 aa  211  2e-53  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  40.42 
 
 
422 aa  209  6e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  42.97 
 
 
272 aa  209  7e-53  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  43.37 
 
 
271 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  41.28 
 
 
279 aa  209  8e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  47.22 
 
 
280 aa  207  2e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  41.07 
 
 
272 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  40.42 
 
 
266 aa  207  3e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  39.34 
 
 
404 aa  207  3e-52  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
272 aa  207  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  42.62 
 
 
270 aa  204  1e-51  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  38.15 
 
 
349 aa  202  5e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  42.19 
 
 
270 aa  202  9e-51  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  37.23 
 
 
270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  36.95 
 
 
344 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  36.55 
 
 
344 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  40.49 
 
 
268 aa  196  5.000000000000001e-49  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  36.95 
 
 
353 aa  194  2e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  36.14 
 
 
350 aa  194  2e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  36.14 
 
 
350 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  36.14 
 
 
350 aa  192  5e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  41.84 
 
 
267 aa  192  9e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  36.29 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  36.65 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  36.29 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  36.65 
 
 
350 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  36.65 
 
 
351 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  36.29 
 
 
347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  36.29 
 
 
344 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  43.51 
 
 
268 aa  184  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  36.25 
 
 
346 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  39.41 
 
 
258 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  39.52 
 
 
275 aa  157  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  38.15 
 
 
285 aa  156  5.0000000000000005e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  37.12 
 
 
254 aa  154  2.9999999999999998e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  34.75 
 
 
268 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  38.02 
 
 
262 aa  152  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  36.63 
 
 
293 aa  152  1e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  36.07 
 
 
268 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  35.95 
 
 
269 aa  147  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  37.61 
 
 
262 aa  146  5e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  38.71 
 
 
298 aa  144  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  41.18 
 
 
268 aa  144  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  35.91 
 
 
275 aa  143  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  37.19 
 
 
269 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  37.19 
 
 
269 aa  142  6e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  37.19 
 
 
269 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  35.1 
 
 
266 aa  141  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  34.85 
 
 
268 aa  140  1.9999999999999998e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  36.82 
 
 
274 aa  140  3e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  35.25 
 
 
255 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  38.29 
 
 
266 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  35.98 
 
 
272 aa  139  7e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  36.07 
 
 
273 aa  135  9.999999999999999e-31  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  34.04 
 
 
265 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  32.51 
 
 
267 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  35.94 
 
 
265 aa  134  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  34.41 
 
 
265 aa  133  5e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  35.44 
 
 
259 aa  132  6e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2943  peptidase M48, Ste24p  39.45 
 
 
269 aa  132  9e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0341999  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3404  peptidase M48 Ste24p  37.44 
 
 
269 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000146898  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  34.14 
 
 
269 aa  132  1.0000000000000001e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.33 
 
 
263 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3529  peptidase M48 Ste24p  37.44 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000517295  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.5 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1048  peptidase M48 Ste24p  37.44 
 
 
269 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000265758  hitchhiker  0.000000297579 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  41.14 
 
 
248 aa  130  3e-29  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.95 
 
 
263 aa  130  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  35.33 
 
 
270 aa  129  7.000000000000001e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03478  peptidase M48, Ste24p  33.2 
 
 
268 aa  129  7.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  36.15 
 
 
231 aa  129  8.000000000000001e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3308  peptidase M48 Ste24p  37 
 
 
269 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000556254  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  31.95 
 
 
271 aa  127  3e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  33.33 
 
 
266 aa  126  5e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>