More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_3157 on replicon NC_008390
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010551  BamMC406_3040  peptidase M48 Ste24p  98.26 
 
 
344 aa  669    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.359784  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3157  peptidase M48, Ste24p  100 
 
 
344 aa  681    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3102  peptidase M48, Ste24p  83.48 
 
 
350 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2488  peptidase M48, Ste24p  83.48 
 
 
350 aa  558  1e-158  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3118  peptidase M48 Ste24p  83.19 
 
 
350 aa  556  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3099  peptidase M48 Ste24p  78.51 
 
 
349 aa  519  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6453  peptidase M48, Ste24p  78.53 
 
 
353 aa  508  1e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0189  hypothetical protein  68.38 
 
 
350 aa  350  2e-95  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0154  M48 family peptidase  67.84 
 
 
346 aa  350  2e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0374  M48 family peptidase  68.8 
 
 
350 aa  349  3e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0179  hypothetical protein  68.8 
 
 
351 aa  350  3e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.308027  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2904  hypothetical protein  67.45 
 
 
344 aa  347  1e-94  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3444  hypothetical protein  67.05 
 
 
347 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2185  hypothetical protein  67.05 
 
 
347 aa  348  1e-94  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3243  hypothetical protein  67.45 
 
 
316 aa  347  2e-94  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0058  peptidase M48 Ste24p  55.19 
 
 
404 aa  343  2e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0332  peptidase M48 Ste24p  58.03 
 
 
422 aa  334  1e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4392  hypothetical protein  58.87 
 
 
266 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.863393  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0192  peptidase M48, Ste24p  44.08 
 
 
319 aa  223  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.461964  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0147  peptidase M48, Ste24p  42.8 
 
 
284 aa  211  2e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0203  peptidase M48, Ste24p  41.13 
 
 
291 aa  209  6e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.23907  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0153  putative signal peptide protein  43.27 
 
 
314 aa  207  2e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.700817  normal  0.82157 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0218  peptidase M48 Ste24p  40.74 
 
 
311 aa  206  6e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0093  putative signal peptide protein  37.25 
 
 
340 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.485946  normal  0.563302 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0332  peptidase M48 Ste24p  38.55 
 
 
305 aa  196  3e-49  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0210  peptidase M48, Ste24p  38.84 
 
 
280 aa  197  3e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0046  peptidase M48 Ste24p  40.98 
 
 
314 aa  196  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.330738 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0280  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
284 aa  195  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0043  peptidase M48 Ste24p  40.57 
 
 
314 aa  194  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2637  peptidase M48, Ste24p  40.08 
 
 
302 aa  193  5e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.148422  normal  0.423145 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0517  peptidase M48, Ste24p  41.15 
 
 
281 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0264  peptidase M48 Ste24p  38.02 
 
 
288 aa  189  4e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.197309  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0153  peptidase M48, Ste24p  38.62 
 
 
280 aa  187  2e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0497682  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4104  peptidase M48 Ste24p  37.34 
 
 
316 aa  172  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000775761 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1887  peptidase M48, Ste24p  36.48 
 
 
274 aa  162  7e-39  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61290  putative lipoprotein  35.34 
 
 
273 aa  155  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5278  putative lipoprotein  34.91 
 
 
273 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0624214  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2062  peptidase M48, Ste24p  37.34 
 
 
270 aa  153  4e-36  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.02015  normal  0.416312 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0212  peptidase M48, Ste24p  35.78 
 
 
267 aa  151  1e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000330567  normal  0.366898 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3072  peptidase M48 Ste24p  35.41 
 
 
271 aa  150  4e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1144  lipoprotein, putative  36.05 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.599312  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0148  peptidase M48, Ste24p  35.94 
 
 
268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4714  peptidase M48, Ste24p  35.34 
 
 
272 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.134186  normal  0.0690011 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1783  zinc metallopeptidase  36.48 
 
 
270 aa  147  3e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1809  peptidase M48 Ste24p  34.62 
 
 
289 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0787  peptidase M48, Ste24p  34.48 
 
 
272 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41270  Peptidase M48, Ste24p family  33.76 
 
 
273 aa  145  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0759  hypothetical protein  34.48 
 
 
279 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0984  peptidase M48, Ste24p  34.91 
 
 
282 aa  143  4e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00306933  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0801  peptidase M48 Ste24p  33.62 
 
 
272 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.740627 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4429  peptidase M48 Ste24p  33.19 
 
 
271 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1865  peptidase M48, Ste24p  35.9 
 
 
280 aa  140  3.9999999999999997e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.130359  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1711  M48 family peptidase  33.77 
 
 
267 aa  135  7.000000000000001e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0032  peptidase M48, Ste24p  32.24 
 
 
270 aa  135  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3668  peptidase M48, Ste24p  32.63 
 
 
273 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0018  peptidase M48, Ste24p  33.62 
 
 
272 aa  132  6e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.273769  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1514  hypothetical protein  32.75 
 
 
254 aa  122  9.999999999999999e-27  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000319394  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0655  peptidase M48, Ste24p  33.33 
 
 
268 aa  120  3e-26  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0730736  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2969  peptidase M48 Ste24p  33.05 
 
 
275 aa  108  9.000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.000829087  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1219  hypothetical protein  33.62 
 
 
258 aa  107  2e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2978  putative lipoprotein  40.41 
 
 
231 aa  106  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2379  peptidase M48 Ste24p  29.69 
 
 
285 aa  106  6e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00799572  normal  0.0495258 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1200  peptidase M48 Ste24p  30.67 
 
 
275 aa  105  2e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.724049 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0548  peptidase M48, Ste24p  29.33 
 
 
268 aa  104  3e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.420219  hitchhiker  0.000000269933 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1308  peptidase M48, Ste24p  29.96 
 
 
293 aa  101  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.038834  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2861  peptidase M48, Ste24p  34.43 
 
 
271 aa  100  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1406  peptidase M48 Ste24p  29.72 
 
 
277 aa  100  4e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00236283 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3278  peptidase M48, Ste24p  26.67 
 
 
265 aa  100  4e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1052  M48 family peptidase  33.14 
 
 
270 aa  99  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2507  hypothetical protein  32.61 
 
 
266 aa  99  1e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00984533  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0972  peptidase M48, Ste24p  32.6 
 
 
268 aa  98.6  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000310302  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2197  hypothetical protein  34.68 
 
 
265 aa  97.4  3e-19  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0980  peptidase M48 Ste24p  26.27 
 
 
275 aa  97.1  4e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.269244  normal  0.374178 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000181  Zn-dependent protease with chaperone function  35 
 
 
262 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.787256  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3407  peptidase M48, Ste24p  30.47 
 
 
266 aa  96.3  7e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.029445  hitchhiker  0.000231655 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2450  peptidase M48, Ste24p  36.24 
 
 
264 aa  95.1  1e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.195879  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2842  peptidase M48, Ste24p  36.41 
 
 
262 aa  95.5  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000706614  normal  0.0604809 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2732  peptidase M48 Ste24p  33.71 
 
 
268 aa  95.1  1e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0992  peptidase M48, Ste24p  35.47 
 
 
272 aa  95.1  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000166595  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6512  peptidase M48 Ste24p  27.16 
 
 
267 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00139826  normal  0.073163 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03289  Zn-dependent protease with chaperone function  30 
 
 
255 aa  93.2  5e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0525  putative lipoprotein  32.65 
 
 
263 aa  93.6  5e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3581  peptidase M48 Ste24p  32.58 
 
 
266 aa  93.2  6e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000704965  normal  0.319279 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3183  peptidase M48 Ste24p  29.76 
 
 
259 aa  92  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.262303  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0964  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00161877  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0962  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
269 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00197465  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0393  peptidase M48 Ste24p  34.5 
 
 
248 aa  91.7  2e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00000617052  hitchhiker  0.0000065256 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1000  peptidase M48, Ste24p  32.81 
 
 
269 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1800  peptidase M48, Ste24p  33.52 
 
 
263 aa  89.7  7e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0722089  normal  0.0408488 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1935  peptidase M48 Ste24p  32.72 
 
 
271 aa  89.7  7e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2747  peptidase M48, Ste24p  25.82 
 
 
269 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0843465  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05815  peptidase  35 
 
 
265 aa  89.4  9e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2068  peptidase M48 Ste24p  32.97 
 
 
320 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1137  hypothetical protein  31.28 
 
 
269 aa  89.4  1e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0012  peptidase M48, Ste24p  32.97 
 
 
284 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3332  peptidase M48, Ste24p  27.78 
 
 
268 aa  87.8  3e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.835171  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12433  hypothetical protein  30.77 
 
 
274 aa  85.5  0.000000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0709327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3078  peptidase M48 Ste24p  31.25 
 
 
266 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000470092  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2760  peptidase M48 Ste24p  29.91 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.293753  normal  0.755034 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1890  Zn-dependent protease  24.7 
 
 
273 aa  82  0.00000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00690721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>